RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414009.1

HPS1-205, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene HPS1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-205ENST00000414009 LMAN2LQ9H0V9 348 aa16.03■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 IKZF4Q9H2S9 585 aa16.03■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 PCIF1Q9H4Z3 704 aa16.03■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 KIAA1586Q9HCI6 787 aa16.03■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 MIOSQ9NXC5 875 aa16.03■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 KIAA1671Q9BY89 1806 aa16.03■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 RFXAPO00287 272 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 PTGESO14684 152 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 HRO43593 1189 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 CALUO43852 315 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 EXTL3O43909 919 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 DDHD2O94830 711 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 MBD3O95983 291 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 GALTP07902 379 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 LINC00271P0C7V0 271 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 ADSSP30520 456 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 PBX3P40426 434 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 PPP1R2P41236 205 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 TNFSF9P41273 254 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 UBE3AQ05086 875 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 SLC10A6Q3KNW5 377 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 COLGALT2Q8IYK4 626 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 SAAL1Q96ER3 474 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 UROC1Q96N76 676 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 KCNK17Q96T54 332 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 HSPBP1Q9NZL4 362 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 CNTN3Q9P232 1028 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 DNAJB4Q9UDY4 337 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 STK39Q9UEW8 545 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 PLAGL2Q9UPG8 496 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS1-205ENST00000414009 TRIP11Q15643 1979 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 EPOPA6NHQ4 379 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 ZNF233A6NK53 670 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 PDXKO00764 312 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 NRP1O14786 923 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 CLIC2O15247 247 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 LPXNO60711 386 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 IL18RAPO95256 599 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 ITGB1P05556 798 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 KCNE1P15382 129 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 SLC11A1P49279 550 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 CYP2J2P51589 502 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 PLCB3Q01970 1234 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 DSC1Q08554 894 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 XKR4Q5GH76 650 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 SLC39A11Q8N1S5 342 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 XXYLT1Q8NBI6 393 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 GSTCDQ8NEC7 633 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 SPATA20Q8TB22 786 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 GUCD1Q96NT3 240 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 NUP62CLQ9H1M0 184 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 CLSTN2Q9H4D0 955 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 ASB7Q9H672 318 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 LMCD1Q9NZU5 365 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 TTC26A0AVF1 554 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 GOLGA8IPA6NC78 632 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 CASTOR2A6NHX0 329 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 GOLGA8JA6NMD2 632 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 LACTBL1A8MY62 500 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 TGFB1I1O43294 461 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 EXOC3O60645 756 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 HOXD13P35453 343 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 SURF1Q15526 300 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 MICALL1Q8N3F8 863 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 BEST2Q8NFU1 509 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 POF1BQ8WVV4 589 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 PPP2R3CQ969Q6 453 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 IGSF21Q96ID5 467 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 TSG101Q99816 390 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 MAN1B1Q9UKM7 699 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 LZTS1Q9Y250 596 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 BIN1O00499 593 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 PSMA7O14818 248 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 GRM6O15303 877 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 FAM189A1O60320 539 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 TADA2AO75478 443 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-205ENST00000414009 CSPG5O95196 566 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms