RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa25.95■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC38A7Q9NVC3 462 aa25.95■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa25.95■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 XIRP2A4UGR9 3374 aa25.94■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 CLIC2O15247 247 aa25.94■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 PLPP4Q5VZY2 271 aa25.94■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 HASPINQ8TF76 798 aa25.94■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 KIF12Q96FN5 646 aa25.94■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 GBP4Q96PP9 640 aa25.94■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa25.94■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 FSCN2O14926 492 aa25.93■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 ADRB2P07550 413 aa25.93■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 CLCNKBP51801 687 aa25.93■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 HS2ST1Q7LGA3 356 aa25.93■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 TMC7Q7Z402 723 aa25.93■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM130Q8N3G9 435 aa25.93■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 SMARCE1Q969G3 411 aa25.93■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa25.93■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 ANK1P16157 1881 aa25.93■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 KIF4AO95239 1232 aa25.92■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 SMC2O95347 1197 aa25.92■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 LDHAP00338 332 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 JADE1Q6IE81 842 aa25.92■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa25.92■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 HSPBP1Q9NZL4 362 aa25.92■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 ADAM28Q9UKQ2 775 aa25.92■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 EXTL3O43909 919 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 TADA2AO75478 443 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 UPP1Q16831 310 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 TAS1R1Q7RTX1 841 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 GPD1LQ8N335 351 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 SPATA20Q8TB22 786 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 AUTS2Q8WXX7 1259 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 UROC1Q96N76 676 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 GSDMAQ96QA5 445 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 ZBP1Q9H171 429 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 RMND1Q9NWS8 449 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 HIDE1A8MVS5 230 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 CA8P35219 290 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 CYP2J2P51589 502 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 ZBTB6Q15916 424 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 CD302Q8IX05 232 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 GPR62Q9BZJ7 368 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 KCTD10Q9H3F6 313 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 B3GAT3O94766 335 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 EFEMP2O95967 443 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 NFICP08651 508 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 WNT7BP56706 349 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 FUT10Q6P4F1 479 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 C3orf58Q8NDZ4 430 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 ASB7Q9H672 318 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
UBE2E3-202ENST00000410062 PODXLO00592 558 aa25.89■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 SOD2P04179 222 aa25.89■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 CTSAP10619 480 aa25.89■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.737e-7■■■■■ 27.5
UBE2E3-202ENST00000410062 GUCY2FP51841 1108 aa25.89■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa25.89■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 CBWD2Q8IUF1 395 aa25.89■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 BRSK2Q8IWQ3 736 aa25.89■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 PRDM6Q9NQX0 595 aa25.89■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 PER2O15055 1255 aa25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 CXCL14O95715 111 aa25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 HYAL1Q12794 435 aa25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM132DQ14C87 1099 aa25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 CAMK4Q16566 473 aa25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 ISM2Q6H9L7 571 aa25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 CD300LGQ6UXG3 332 aa25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 RDH13Q8NBN7 331 aa25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 B3GALT6Q96L58 329 aa25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 IGFLR1Q9H665 355 aa25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 UNC80Q8N2C7 3258 aa25.88■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 KIF20AO95235 890 aa25.87■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 IL18RAPO95256 599 aa25.87■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 NRIP1P48552 1158 aa25.87■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 C12orf56Q8IXR9 622 aa25.87■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 GOLGA5Q8TBA6 731 aa25.87■■□□□ 1.73
UBE2E3-202ENST00000410062 TSPAN18Q96SJ8 248 aa25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms