RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 CXCL12P48061 93 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 FNTBP49356 437 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 FAM78AQ5JUQ0 283 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 PRSS36Q5K4E3 855 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 IER2Q9BTL4 223 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 ZFP14Q9HCL3 533 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 MARCH6O60337 910 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 DGAT1O75907 488 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 RECQL4O94761 1208 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 DEXIO95424 95 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 CHRNB1P11230 501 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 EVCP57679 992 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 GALNT17Q6IS24 598 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 NEK8Q86SG6 692 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 POTEDQ86YR6 584 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 PIAS3Q9Y6X2 628 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD12-201ENST00000404162 TBX3O15119 743 aa21.32■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 TKTP29401 623 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 PMLP29590 882 aa21.32■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 GDI1P31150 447 aa21.32■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.32■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 CD300LGQ6UXG3 332 aa21.32■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 VITQ6UXI7 678 aa21.32■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.32■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 SKAP1Q86WV1 359 aa21.32■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 IRF7Q92985 503 aa21.32■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 CORO1BQ9BR76 489 aa21.32■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.32■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 BACE2Q9Y5Z0 518 aa21.32■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 A0A087WWV3 80 aa21.31■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.31■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.31■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 LRG1P02750 347 aa21.31■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 CCR2P41597 374 aa21.31■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.31■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 ASB16Q96NS5 453 aa21.31■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.31■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 TRPV5Q9NQA5 729 aa21.31■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 ANKEF1Q9NU02 776 aa21.31■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 USP20Q9Y2K6 914 aa21.31■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 F5P12259 2224 aa21.31■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.3■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa21.3■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 I3L4J1 428 aa21.3■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 B3GAT3O94766 335 aa21.3■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 CCNE1P24864 410 aa21.3■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 HOXC13P31276 330 aa21.3■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 BRCC3P46736 316 aa21.3■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 RARRES1P49788 294 aa21.3■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 CLCNKBP51801 687 aa21.3■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 IL31Q6EBC2 164 aa21.3■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.3■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.3■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 ZSWIM3Q96MP5 696 aa21.3■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.3■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 FZD8Q9H461 694 aa21.3■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 WDR27A2RRH5 827 aa21.29■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 K7ESF4 209 aa21.29■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 LYPLA2O95372 231 aa21.29■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 PSMC3P17980 439 aa21.29■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 HSPA4P34932 840 aa21.29■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 VIPR2P41587 438 aa21.29■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 ROR1Q01973 937 aa21.29■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.29■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 ANKS3Q6ZW76 656 aa21.29■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 LONP2Q86WA8 852 aa21.29■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.29■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.29■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 NCANO14594 1321 aa21.29■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 PRRG1O14668 218 aa21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF197O14709 1029 aa21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 TM4SF5O14894 197 aa21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 N4BP3O15049 544 aa21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 ABLIM3O94929 683 aa21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 SEC24AO95486 1093 aa21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 ELF1P32519 619 aa21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms