RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 HVCN1Q96D96 273 aa13.66□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 PCIF1Q9H4Z3 704 aa13.66□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 FAN1Q9Y2M0 1017 aa13.66□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 STYXL1Q9Y6J8 313 aa13.66□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 MYO7AQ13402 2215 aa13.66□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 SYCE3A1L190 88 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 GOLGA8IPA6NC78 632 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 GOLGA8JA6NMD2 632 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 OGTO15294 1046 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 ALDH2P05091 517 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 BMT2Q1RMZ1 405 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 XKR4Q5GH76 650 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 TAS1R1Q7RTX1 841 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 HASPINQ8TF76 798 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 POMGNT1Q8WZA1 660 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 FAM212AQ96EL1 285 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 SAAL1Q96ER3 474 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 CBWD1Q9BRT8 395 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 TMEM175Q9BSA9 504 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 TMEM206Q9H813 350 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 LMCD1Q9NZU5 365 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 EXOC7Q9UPT5 735 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 EYSQ5T1H1 3165 aa13.65□□□□□ -0.22
CNMD-201ENST00000377962 LACTBL1A8MY62 500 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 TGFB1I1O43294 461 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 KIF20AO95235 890 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 CLTAP09496 248 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 PPM1AP35813 382 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 WNT7BP56706 349 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 KRT17Q04695 432 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 TUSC3Q13454 348 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 COBLL1Q53SF7 1204 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 PLPP4Q5VZY2 271 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 SLFN12LQ6IEE8 588 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 ADSSL1Q8N142 457 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 MLKLQ8NB16 471 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 RSPH1Q8WYR4 309 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 B3GALT6Q96L58 329 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 LMAN2LQ9H0V9 348 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 TLR9Q9NR96 1032 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 UBE4BO95155 1302 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 TTC26A0AVF1 554 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 HIDE1A8MVS5 230 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 FSCN2O14926 492 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 PER2O15055 1255 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 CLIC2O15247 247 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 KIF4AO95239 1232 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 CLCNKBP51801 687 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 GUCY2FP51841 1108 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 TYRO3Q06418 890 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 STIM1Q13586 685 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 DPCR1Q3MIW9 517 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 KLHL10Q6JEL2 608 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 VPS52Q8N1B4 723 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 TMEM169Q96HH4 297 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 FAM84AQ96KN4 292 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 TCF25Q9BQ70 676 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 FAM213AQ9BRX8 229 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 KCTD10Q9H3F6 313 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 IGFLR1Q9H665 355 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 ANO10Q9NW15 660 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 CNTN3Q9P232 1028 aa13.64□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 COL6A3P12111 3177 aa13.63□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 LINC01565O15544 149 aa13.63□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 KCNE1P15382 129 aa13.63□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 CA8P35219 290 aa13.63□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 PPP1R2P41236 205 aa13.63□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 RBM10P98175 930 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 UBE3AQ05086 875 aa13.63□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 HYAL1Q12794 435 aa13.63□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 STX1AQ16623 288 aa13.63□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 JADE1Q6IE81 842 aa13.63□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 ARMCX5Q6P1M9 558 aa13.63□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 CD300LGQ6UXG3 332 aa13.63□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 TMC7Q7Z402 723 aa13.63□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 C3orf58Q8NDZ4 430 aa13.63□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 COLEC11Q9BWP8 271 aa13.63□□□□□ -0.23
CNMD-201ENST00000377962 GPR62Q9BZJ7 368 aa13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms