RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 TIPINQ9BVW5 301 aa14.09□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.09□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.09□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 AZI2Q9H6S1 392 aa14.09□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.09□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 WDR64B1ANS9 1081 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 CYP1A2P05177 515 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 NUDT17P0C025 328 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 KRT5P13647 590 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 NPTX2P47972 431 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 RWDD2BP57060 319 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 PGM5Q15124 567 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC25Q86WR0 208 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 KIFAP3Q92845 792 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 RMDN3Q96TC7 470 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 GGT7Q9UJ14 662 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.08□□□□□ -0.15
TMOD1-202ENST00000375175 CFAP73A6NFT4 308 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 A8MUI8 341 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 MTA2O94776 668 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 CCNE2O96020 404 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 RARAP10276 462 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 FGFR4P22455 802 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 GBP1P32455 592 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 SOX10P56693 466 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 CDR2Q01850 454 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 CD101Q93033 1021 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM8AQ9HCN3 771 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 RAB20Q9NX57 234 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 ETAA1Q9NY74 926 aa14.08□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 IRF6O14896 467 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 PMM2O15305 246 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 CALCAP01258 141 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 SLCO1A2P46721 670 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 JAK3P52333 1124 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 ITIH4Q14624 930 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 RNF207Q6ZRF8 634 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 FAM83AQ86UY5 434 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 HELQQ8TDG4 1101 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 PASKQ96RG2 1323 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 CLDN3O15551 220 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 ALADP13716 330 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 UVRAGQ9P2Y5 699 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 USP20Q9Y2K6 914 aa14.07□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 ASAP2O43150 1006 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 UBOX5O94941 541 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 UPP2O95045 317 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 GPC3P51654 580 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 NCALDP61601 193 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 KRT76Q01546 638 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 CALCOCO2Q13137 446 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 SNX1Q13596 522 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 SLMAPQ14BN4 828 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 ERICH1Q86X53 443 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 TTLL6Q8N841 843 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 C1orf54Q8WWF1 131 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 CENPTQ96BT3 561 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 PGM2Q96G03 612 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 CEP170P1Q96L14 293 aa14.06□□□□□ -0.16
TMOD1-202ENST00000375175 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms