RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 PITRM1Q5JRX3 1037 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 VGLL2Q8N8G2 317 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 FCRL4Q96PJ5 515 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 FLRT1Q9NZU1 646 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 BMP15O95972 392 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 PTGER1P34995 402 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 TERF2Q15554 542 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 TSTD2Q5T7W7 516 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 FCRLBQ6BAA4 426 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
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PTPRC-202ENST00000367364 MRI1Q9BV20 369 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 RPTORQ8N122 1335 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 KPNA6O60684 536 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 SQSTM1Q13501 440 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 AFMIDQ63HM1 303 aa5.9□□□□□ -1.46
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PTPRC-202ENST00000367364 AMIGO2Q86SJ2 522 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 ARMC5Q96C12 935 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 KCTD10Q9H3F6 313 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 HSFX1Q9UBD0 423 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 ADAM21Q9UKJ8 722 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
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PTPRC-202ENST00000367364 LPLP06858 475 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 LSP1P33241 339 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 SP140Q13342 867 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 Q6ZVL8 140 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 COLGALT2Q8IYK4 626 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 YY2O15391 372 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 PRR35P0CG20 571 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 LGALS4P56470 323 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 UBXN2BQ14CS0 331 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 ETFDHQ16134 617 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 VWA1Q6PCB0 445 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 FOXR2Q6PJQ5 311 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 FRMD7Q6ZUT3 714 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 SMC1BQ8NDV3 1235 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 OR7D4Q8NG98 312 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 ADGRE3Q9BY15 652 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 SPTLC3Q9NUV7 552 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 MPPED1O15442 326 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 KDM1AO60341 852 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 PHF2O75151 1096 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 RFPL3O75679 317 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 NTN1O95631 604 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 POMCP01189 267 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
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PTPRC-202ENST00000367364 Q8NA96 180 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 SPATA3Q8NHX4 192 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 WACQ9BTA9 647 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 WNT6Q9Y6F9 365 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC151A5D8V7 595 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-202ENST00000367364 CCKBRP32239 447 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 SREBF1P36956 1147 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 FHL1Q13642 323 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-202ENST00000367364 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 TFAP2BQ92481 460 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-202ENST00000367364 BCO1Q9HAY6 547 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 EDARQ9UNE0 448 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 BTBD3Q9Y2F9 522 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF521Q96K83 1311 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 ORC4O43929 436 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 RAP2AP10114 183 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 CKBP12277 381 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
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PTPRC-202ENST00000367364 SOX10P56693 466 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRC-202ENST00000367364 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
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PTPRC-202ENST00000367364 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 PROM1O43490 865 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 AKR1B10O60218 316 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 CBSLP0DN79 551 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 ATP5JP18859 108 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-202ENST00000367364 CBSP35520 551 aa5.84□□□□□ -1.47
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