RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362913.1

SNORD56.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 68 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.1-201ENST00000362913 EMC10Q5UCC4 262 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 RNF220Q5VTB9 566 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 AFMIDQ63HM1 303 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 GLB1LQ6UWU2 654 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 KSR2Q6VAB6 950 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 LCNL1Q6ZST4 164 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 CCDC149Q6ZUS6 474 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 PDSS2Q86YH6 399 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 KRT78Q8N1N4 520 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 SAMD3Q8N6K7 520 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 SYT8Q8NBV8 401 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 REPS2Q8NFH8 660 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 MDGA1Q8NFP4 955 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 FEZF2Q8TBJ5 459 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 LRTOMTQ8WZ04 291 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 ST8SIA2Q92186 375 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 TIFAQ96CG3 184 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLC35A4Q96G79 324 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 CEP95Q96GE4 821 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 SUCLG2Q96I99 432 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 MRI1Q9BV20 369 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 B3GNT5Q9BYG0 378 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 BTBD1Q9H0C5 482 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 NUP62CLQ9H1M0 184 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 KCNH6Q9H252 994 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 LDAHQ9H6V9 325 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 ABCF2Q9UG63 623 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP25Q9UHP3 1055 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 ACTL7AQ9Y615 435 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 DUSP10Q9Y6W6 482 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZMYM3Q14202 1370 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 A6NNZ2 444 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 ISM1B1AKI9 464 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 F2RL2O00254 374 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLC43A1O75387 559 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 POMCP01189 267 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 GNAI3P08754 354 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 FPR1P21462 350 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 PRDX5P30044 214 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 GNAI1P63096 354 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 SEMA5AQ13591 1074 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 COBLL1Q53SF7 1204 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 ERICH6BQ5W0A0 696 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 TCTN3Q6NUS6 607 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 EFCAB12Q6NXP0 572 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 FAM90A1Q86YD7 464 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 FAM156AQ8NDB6 213 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 STON2Q8WXE9 905 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 TFAP2CQ92754 450 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 MIEF2Q96C03 454 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 FAM89AQ96GI7 184 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 APIPQ96GX9 242 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 OR14A2Q96R54 314 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 NDC1Q9BTX1 674 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 LRRC27Q9C0I9 530 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 SIK2Q9H0K1 926 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLC52A1Q9NWF4 448 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 JKAMPQ9P055 326 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 CFAP97Q9P2B7 532 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 TPCN1Q9ULQ1 816 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 A0A1W2PPL8 197 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 CFAP69A5D8W1 941 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 LRRC14BA6NHZ5 514 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 PATE3B3GLJ2 98 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 GRM6O15303 877 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 HAUS5O94927 633 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 ITGB3P05106 788 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 CD1AP06126 327 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 THP07101 528 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 COMTP21964 271 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 PEX2P28328 305 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 PIK3CGP48736 1102 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 FOXL1Q12952 345 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 UBXN2BQ14CS0 331 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 BRD3Q15059 726 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 LLGL1Q15334 1064 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 HS1BP3Q53T59 392 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZNF365Q70YC5 407 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms