RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 KCNN4O15554 427 aa22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 CDK17Q00537 523 aa22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 PIDD1Q9HB75 910 aa22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 NR1H3Q13133 447 aa22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 PHEXP78562 749 aa22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 RALAP11233 206 aa22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ANO4Q32M45 955 aa22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 TAS2R42Q7RTR8 314 aa22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 KRT82Q9NSB4 513 aa22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SLC1A1P43005 524 aa22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 MAGEB5Q9BZ81 275 aa22.26■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 KCND2Q9NZV8 630 aa22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 FAM8A1Q9UBU6 413 aa22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 PPFIA2O75334 1257 aa22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 TPI1P60174 286 aa22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ACAD11Q709F0 780 aa22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 STK25O00506 426 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 GJB7Q6PEY0 223 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 LCA5Q86VQ0 697 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ZBTB18Q99592 522 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 GRAP2O75791 330 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 PRAMEP78395 509 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 PTPAQ15257 358 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 OR6P1Q8NGX9 317 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SUN2Q9UH99 717 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 GYG2O15488 501 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 NPEPPSP55786 919 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 NCLNQ969V3 563 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 RFC5P40937 340 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 AP1ARQ63HQ0 302 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SNX19Q92543 992 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 MAP3K14Q99558 947 aa22.24■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ESRRBO95718 433 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 HMBSP08397 361 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SZRD1Q7Z422 152 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 PGBD4Q96DM1 585 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ASIC4Q96FT7 647 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 BFARQ9NZS9 450 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 PARP9Q8IXQ6 854 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SCOCQ9UIL1 159 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 ASAP2O43150 1006 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 PDGFRAP16234 1089 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 MDH1P40925 334 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 CCL15Q16663 113 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 SPATA17Q96L03 361 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 EPN3Q9H201 632 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM66O15016 1216 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 DIAPH2O60879 1101 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 HLA-DRAP01903 254 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 RPA1P27694 616 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 NNMTP40261 264 aa22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SMURF1-201ENST00000361125 RMDN1Q96DB5 314 aa22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms