RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA8SH3BPF8 625 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MEIS2O14770 477 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 EPC2Q52LR7 807 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TYW1BQ6NUM6 668 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC17AQ6ZS10 378 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TADA2BQ86TJ2 420 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 C4orf19Q8IY42 314 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00301Q8NCQ3 95 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FBXO32Q969P5 355 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PBX4Q9BYU1 374 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 USTQ9Y2C2 406 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NID2Q14112 1375 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SLC37A4O43826 429 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CNMDO75829 334 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 F2P00734 622 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TNFAIP3P21580 790 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 WDR5P61964 334 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SPA17Q15506 151 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PTPN14Q15678 1187 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FBXO47Q5MNV8 452 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TAPT1Q6NXT6 567 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FAM122AQ96E09 287 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CHST12Q9NRB3 414 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 IRAK4Q9NWZ3 460 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 RCOR1Q9UKL0 485 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CA14Q9ULX7 337 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHA7Q9UN72 937 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PLA2G4CQ9UP65 541 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 UTRNP46939 3433 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FAM186AA6NE01 2351 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SYCE3A1L190 88 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM43BA6NCK2 446 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA8CPA6NN73 597 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 AGRPO00253 132 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TOM1L1O75674 476 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 HDCP19113 662 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 RPA1P27694 616 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GABRR2P28476 465 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NAMPTP43490 491 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 NOVP48745 357 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 HSD17B4P51659 736 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MAP3K10Q02779 954 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GSE1Q14687 1217 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SLC39A14Q15043 492 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 CATSPER3Q86XQ3 398 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SKA1Q96BD8 255 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FAM49BQ9NUQ9 324 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TJP2Q9UDY2 1190 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PIEZO1Q92508 2521 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 TMCO5BA8MYB1 307 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 APOEP02649 317 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ITGB3P05106 788 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1328Q86T90 577 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FAM126BQ8IXS8 530 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GPT2Q8TD30 523 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PARD3BQ8TEW8 1205 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 DDI1Q8WTU0 396 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 DPP3Q9NY33 737 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 RASAL2Q9UJF2 1139 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CTNND2Q9UQB3 1225 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
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