RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
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CLN8-201ENST00000331222 ASZ1Q8WWH4 475 aa11.13□□□□□ -0.63
CLN8-201ENST00000331222 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
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CLN8-201ENST00000331222 SEZ6Q53EL9 994 aa11.12□□□□□ -0.63
CLN8-201ENST00000331222 RESP18Q5W5W9 173 aa11.12□□□□□ -0.63
CLN8-201ENST00000331222 KIAA2013Q8IYS2 634 aa11.12□□□□□ -0.63
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CLN8-201ENST00000331222 IGFLR1Q9H665 355 aa11.12□□□□□ -0.63
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CLN8-201ENST00000331222 NME5P56597 212 aa11.11□□□□□ -0.63
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CLN8-201ENST00000331222 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.11□□□□□ -0.63
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CLN8-201ENST00000331222 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa11.11□□□□□ -0.63
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CLN8-201ENST00000331222 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CLN8-201ENST00000331222 HIST1H2ADP20671 130 aa11.11□□□□□ -0.63
CLN8-201ENST00000331222 APBA1Q02410 837 aa11.11□□□□□ -0.63
CLN8-201ENST00000331222 TMEM132DQ14C87 1099 aa11.11□□□□□ -0.63
CLN8-201ENST00000331222 TOMM20Q15388 145 aa11.11□□□□□ -0.63
CLN8-201ENST00000331222 STX19Q8N4C7 294 aa11.11□□□□□ -0.63
CLN8-201ENST00000331222 ARMC2Q8NEN0 867 aa11.11□□□□□ -0.63
CLN8-201ENST00000331222 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa11.11□□□□□ -0.63
CLN8-201ENST00000331222 HIST1H2AJQ99878 128 aa11.11□□□□□ -0.63
CLN8-201ENST00000331222 H2AFJQ9BTM1 129 aa11.11□□□□□ -0.63
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