RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283249.6

ITGB6-201, Transcript of integrin subunit beta 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGB6, Length 4,675 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6-201ENST00000283249 ITGA8P53708 1063 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 EXT2Q93063 718 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 ZNF408Q9H9D4 720 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 SENP2Q9HC62 589 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 PPME1Q9Y570 386 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 DUSP10Q9Y6W6 482 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 CLTCL1P53675 1640 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 H3BRJ5 948 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 KRT4P19013 534 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 ZNF543Q08ER8 600 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 DNAJC3Q13217 504 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 GRM1Q13255 1194 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 LRRC36Q1X8D7 754 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 ZNF568Q3ZCX4 644 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 TTI2Q6NXR4 508 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 LVRNQ6Q4G3 990 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 PODNQ7Z5L7 613 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 NCLNQ969V3 563 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 C18orf8Q96DM3 657 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 DCLRE1BQ9H816 532 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 KCND1Q9NSA2 647 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 PKD2L2Q9NZM6 624 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGB6-201ENST00000283249 M0QYV0 167 aa9.9□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SERPINB3P29508 390 aa9.9□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 NEK2P51955 445 aa9.9□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 TROAPQ12815 778 aa9.9□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 TRADDQ15628 312 aa9.9□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SLC30A5Q8TAD4 765 aa9.9□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ACTRT1Q8TDG2 376 aa9.9□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 EME1Q96AY2 570 aa9.9□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.9□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 MTMR4Q9NYA4 1195 aa9.9□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 HSPBP1Q9NZL4 362 aa9.9□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 APOA1P02647 267 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 CRKP46108 304 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 FSD1LQ9BXM9 530 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 NARFQ9UHQ1 456 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 GTF3C4Q9UKN8 822 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SPDYE2BA6NHP3 402 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ADCY3O60266 1144 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 APRTP07741 180 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SPDYE6P0CI01 402 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 GHRP10912 638 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 RPA1P27694 616 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ERFP50548 548 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 NPEPPSP55786 919 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 INPP5AQ14642 412 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 STXBP2Q15833 593 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ARHGEF26Q96DR7 871 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 MTRQ99707 1265 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 AGXT2Q9BYV1 514 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 TMEM117Q9H0C3 514 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 GOLPH3Q9H4A6 298 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 GABBR1Q9UBS5 961 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 APBA3O96018 575 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 AKR1B1P15121 316 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 SERPINB10P48595 397 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 PID1Q7Z2X4 250 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 GLI2P10070 1586 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 H0Y626 953 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 APOL1O14791 398 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 TRIM16O95361 564 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGB6-201ENST00000283249 NPR1P16066 1061 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms