RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 RHOBTB3O94955 611 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 KIF4AO95239 1232 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 CTSAP10619 480 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 CLCNKBP51801 687 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 PNOCQ13519 176 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 UPP1Q16831 310 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 CTC1Q2NKJ3 1217 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 PLPP4Q5VZY2 271 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 KANK3Q6NY19 840 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 TMC7Q7Z402 723 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 AUTS2Q8WXX7 1259 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 EXOC1Q9NV70 894 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 ADAM28Q9UKQ2 775 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 UBE4BO95155 1302 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 C2orf71A6NGG8 1288 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 WNT7BP56706 349 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 NELFCDQ8IXH7 590 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 C3orf58Q8NDZ4 430 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 SAAL1Q96ER3 474 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 CHST7Q9NS84 486 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 IRAK3Q9Y616 596 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 PER2O15055 1255 aa24.25■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 CXCL14O95715 111 aa24.25■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 SOD2P04179 222 aa24.25■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 LTBRP36941 435 aa24.25■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 KCNB1Q14721 858 aa24.25■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 FUT10Q6P4F1 479 aa24.25■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 SPATA20Q8TB22 786 aa24.25■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa24.25■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa24.25■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 SLC38A7Q9NVC3 462 aa24.25■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa24.25■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 A0A0C4DFX4 3053 aa24.24■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa24.24■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 LINC01565O15544 149 aa24.24■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 NRIP1P48552 1158 aa24.24■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 ADAM15Q13444 863 aa24.24■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 KCNC3Q14003 757 aa24.24■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 PTPN14Q15678 1187 aa24.24■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0319Q5VV43 1072 aa24.24■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa24.24■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 HASPINQ8TF76 798 aa24.24■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 UROC1Q96N76 676 aa24.24■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.24■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA8IPA6NC78 632 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA8JA6NMD2 632 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 TADA2AO75478 443 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 PPP2R3AQ06190 1150 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 DUSP6Q16828 381 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 JADE1Q6IE81 842 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 ARMCX5Q6P1M9 558 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 CD302Q8IX05 232 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 VN1R2Q8NFZ6 395 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 KIF12Q96FN5 646 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 B3GALT6Q96L58 329 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 KCTD10Q9H3F6 313 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 IGFLR1Q9H665 355 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 ASB7Q9H672 318 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 TLE6Q9H808 572 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 STK39Q9UEW8 545 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 EXTL3O43909 919 aa24.22■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 GLP2RO95838 553 aa24.22■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 LDHAP00338 332 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 CYP3A5P20815 502 aa24.22■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 GUCY2FP51841 1108 aa24.22■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 UBE2HP62256 183 aa24.22■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 RBM10P98175 930 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 TFF2Q03403 129 aa24.22■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 HLA-CQ95604 372 aa24.22■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 FAM212AQ96EL1 285 aa24.22■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 FBXL18Q96ME1 805 aa24.22■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN18Q96SJ8 248 aa24.22■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 HSPBP1Q9NZL4 362 aa24.22■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa24.22■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 VWA8A3KMH1 1905 aa24.22■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 PODXLO00592 558 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 CLIC2O15247 247 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 B3GAT3O94766 335 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 NFICP08651 508 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 LRPAP1P30533 357 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 RPL9P32969 192 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 DSG1Q02413 1049 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 SPATA1Q5VX52 437 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-201ENST00000236273 BRSK2Q8IWQ3 736 aa24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms