RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
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ZNF548-208ENST00000597576 PCNX2A6NKB5 2137 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CACNA1EQ15878 2313 aa8.59□□□□□ -1.03
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ZNF548-208ENST00000597576 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.59□□□□□ -1.03
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ZNF548-208ENST00000597576 FSIP1Q8NA03 581 aa8.59□□□□□ -1.03
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ZNF548-208ENST00000597576 EPSTI1Q96J88 318 aa8.59□□□□□ -1.03
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ZNF548-208ENST00000597576 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.59□□□□□ -1.03
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ZNF548-208ENST00000597576 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PLA2G4FQ68DD2 849 aa8.58□□□□□ -1.04
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ZNF548-208ENST00000597576 SHC4Q6S5L8 630 aa8.58□□□□□ -1.04
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ZNF548-208ENST00000597576 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.58□□□□□ -1.04
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ZNF548-208ENST00000597576 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 E9PMD0 336 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 LAMTOR5O43504 91 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 MGEA5O60502 916 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 FAM13AO94988 1023 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 MBD3O95983 291 aa8.57□□□□□ -1.04
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