RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589706.1

SMAD4-208, Transcript of SMAD family member 4, human

TSL 3

Gene SMAD4, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD4-208	ENST00000589706	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SMAD4-208	ENST00000589706	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SMAD4-208	ENST00000589706	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SMAD4-208	ENST00000589706	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SMAD4-208	ENST00000589706	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SMAD4-208	ENST00000589706	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SMAD4-208	ENST00000589706	POLK	Q9UBT6	870 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SMAD4-208	ENST00000589706	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SMAD4-208	ENST00000589706	MSRA	Q9UJ68	235 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SMAD4-208	ENST00000589706	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SMAD4-208	ENST00000589706	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	SLC27A2	O14975	620 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	ERC2	O15083	957 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	NTRK1	P04629	796 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	MSL3P1	P0C860	447 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	ALDH1B1	P30837	517 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	SDHA	P31040	664 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	GJA4	P35212	333 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	FNTB	P49356	437 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	EPHA5	P54756	1037 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	MVK	Q03426	396 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	BRD3	Q15059	726 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	EPHA7	Q15375	998 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	SLC14A2	Q15849	920 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	FAM107B	Q9H098	131 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	TADA3	O75528	432 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	SETSIP	P0DME0	302 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	TRIM27	P14373	513 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	TACR1	P25103	407 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	SLC6A11	P48066	632 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	CXCL9	Q07325	125 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	ADCY1	Q08828	1119 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	BNIP3	Q12983	259 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	SLC39A6	Q13433	755 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	TUSC3	Q13454	348 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	GBX1	Q14549	363 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	NUP43	Q8NFH3	380 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	SVIP	Q8NHG7	77 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	JADE3	Q92613	823 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	TIFA	Q96CG3	184 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	SARG	Q9BW04	601 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	SNED1	Q8TER0	1413 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706		A0A1W2PQJ5	194 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	SGSM2	O43147	1006 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	ASGR2	P07307	311 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	TPM1	P09493	284 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	TMEM253	P0C7T8	217 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	PRKCA	P17252	672 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	ENPP1	P22413	925 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	AKAP5	P24588	427 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	CD96	P40200	585 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	CHRNE	Q04844	493 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	MOGS	Q13724	837 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SMAD4-208	ENST00000589706	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36

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