RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581598.1

CCDC42-203, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC42, Length 538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-203ENST00000581598 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.99■■□□□ 1.27
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CCDC42-203ENST00000581598 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC42-203ENST00000581598 CCDC169A6NNP5 214 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC42-203ENST00000581598 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC42-203ENST00000581598 KIF4AO95239 1232 aa22.98■■□□□ 1.27
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CCDC42-203ENST00000581598 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.98■■□□□ 1.27
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CCDC42-203ENST00000581598 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC42-203ENST00000581598 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.98■■□□□ 1.27
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CCDC42-203ENST00000581598 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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CCDC42-203ENST00000581598 STAMQ92783 540 aa22.96■■□□□ 1.27
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CCDC42-203ENST00000581598 SLC16A4O15374 487 aa22.93■■□□□ 1.26
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CCDC42-203ENST00000581598 CEP120Q8N960 986 aa22.93■■□□□ 1.26
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CCDC42-203ENST00000581598 PLA2G4BP0C869 781 aa22.92■■□□□ 1.26
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CCDC42-203ENST00000581598 PTPN5P54829 565 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC42-203ENST00000581598 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CCDC42-203ENST00000581598 TDGQ13569 410 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC42-203ENST00000581598 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CCDC42-203ENST00000581598 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC42-203ENST00000581598 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC42-203ENST00000581598 CEP57Q86XR8 500 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC42-203ENST00000581598 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC42-203ENST00000581598 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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