RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575176.5

SMG6-216, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 4

Gene SMG6, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-216ENST00000575176 MYBP10242 640 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 KCNE1P15382 129 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 KCNA5P22460 613 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 STAT6P42226 847 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 COASYQ13057 564 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 TUSC3Q13454 348 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 ZBTB6Q15916 424 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 RTP2Q5QGT7 225 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 DYMQ7RTS9 669 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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SMG6-216ENST00000575176 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 SLC22A17Q8WUG5 538 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 SUSD6Q92537 303 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 B3GALT6Q96L58 329 aa9.51□□□□□ -0.89
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SMG6-216ENST00000575176 GDAQ9Y2T3 454 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 CASTOR2A6NHX0 329 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 MBTPS2O43462 519 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 FAM13AO94988 1023 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 PFKFB1P16118 471 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 DSG1Q02413 1049 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 UPP1Q16831 310 aa9.5□□□□□ -0.89
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SMG6-216ENST00000575176 ZBTB33Q86T24 672 aa9.5□□□□□ -0.89
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SMG6-216ENST00000575176 VPS52Q8N1B4 723 aa9.5□□□□□ -0.89
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SMG6-216ENST00000575176 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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SMG6-216ENST00000575176 SEL1LQ9UBV2 794 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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SMG6-216ENST00000575176 TECTAO75443 2155 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.49□□□□□ -0.89
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SMG6-216ENST00000575176 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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SMG6-216ENST00000575176 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 CNPP09543 421 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 EPCAMP16422 314 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 SCP2P22307 547 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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SMG6-216ENST00000575176 CLCN4P51793 760 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 CLCNKBP51801 687 aa9.49□□□□□ -0.89
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SMG6-216ENST00000575176 ZP2Q05996 745 aa9.49□□□□□ -0.89
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SMG6-216ENST00000575176 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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SMG6-216ENST00000575176 SV2BQ7L1I2 683 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 EFCAB13Q8IY85 973 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 HASPINQ8TF76 798 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 FAM84AQ96KN4 292 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 C7orf25Q9BPX7 421 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 CUEDC2Q9H467 287 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.49□□□□□ -0.89
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SMG6-216ENST00000575176 PTPRJQ12913 1337 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 PATJQ8NI35 1801 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-216ENST00000575176 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
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