RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 MEA1Q16626 185 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF423Q2M1K9 1284 aa5.95□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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CAPN3-211ENST00000562199 PCNX4Q63HM2 1172 aa5.95□□□□□ -1.46
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CAPN3-211ENST00000562199 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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CAPN3-211ENST00000562199 CRYMQ14894 314 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 ATP2B3Q16720 1220 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF792Q3KQV3 632 aa5.94□□□□□ -1.46
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CAPN3-211ENST00000562199 GPR158Q5T848 1215 aa5.94□□□□□ -1.46
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CAPN3-211ENST00000562199 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP5.94□□□□□ -1.46
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CAPN3-211ENST00000562199 NT5C1BQ96P26 610 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 CTAGE1Q96RT6 745 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 PIGSQ96S52 555 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 APOL5Q9BWW9 433 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 LACRTQ9GZZ8 138 aa5.94□□□□□ -1.46
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