RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 GPD1LQ8N335 351 aa23.08■■□□□ 1.28
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MEIS3-212ENST00000561293 PDE11AQ9HCR9 933 aa23.08■■□□□ 1.28
MEIS3-212ENST00000561293 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa23.08■■□□□ 1.28
MEIS3-212ENST00000561293 INSL6Q9Y581 213 aa23.08■■□□□ 1.28
MEIS3-212ENST00000561293 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
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MEIS3-212ENST00000561293 TRIM49P0CI25 452 aa23.02■■□□□ 1.28
MEIS3-212ENST00000561293 TRIM49CP0CI26 452 aa23.02■■□□□ 1.28
MEIS3-212ENST00000561293 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
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MEIS3-212ENST00000561293 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.02■■□□□ 1.28
MEIS3-212ENST00000561293 C12orf56Q8IXR9 622 aa23.02■■□□□ 1.28
MEIS3-212ENST00000561293 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa23.02■■□□□ 1.28
MEIS3-212ENST00000561293 OR5B17Q8NGF7 314 aa23.02■■□□□ 1.28
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