RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556339.5

ATXN3-240, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 525 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-240ENST00000556339 TESK1Q15569 626 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 CCL15Q16663 113 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 SKIDA1Q1XH10 827 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 NRN1LQ496H8 165 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 GORABQ5T7V8 394 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 Q6ZUG5 572 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 MIGA2Q7L4E1 593 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 KLHDC4Q8TBB5 520 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 WDR66Q8TBY9 1149 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 Q8TCH9 128 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 CD99L2Q8TCZ2 262 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 SSH1Q8WYL5 1049 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 OPTNQ96CV9 577 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 ADOQ96SZ5 270 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 TMEM39BQ9GZU3 492 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 USP44Q9H0E7 712 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 CSRNP2Q9H175 543 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 PCED1AQ9H1Q7 454 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 EYA2O00167 538 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 ZNF609O15014 1411 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 KLHL18O94889 574 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 CKMP06732 381 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 CETPP11597 493 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 SPIRE1Q08AE8 756 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 TCP10Q12799 353 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 KLF10Q13118 480 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 CRHR2Q13324 411 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 TUSC3Q13454 348 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 SNAPC2Q13487 334 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 ATP2B3Q16720 1220 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 DENND5AQ6IQ26 1287 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 OTOP1Q7RTM1 612 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 STPG3Q8N7X2 389 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 ANKRD44Q8N8A2 993 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 DTX3Q8N9I9 347 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 LPIN2Q92539 896 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 NEUROD6Q96NK8 337 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 KCNJ15Q99712 375 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 IER2Q9BTL4 223 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 SEC61A2Q9H9S3 476 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 GPR27Q9NS67 375 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 WASF3Q9UPY6 502 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 CEP290O15078 2479 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 AOX1Q06278 1338 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 H0Y858 1186 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 CHGBP05060 677 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 HOXD10P28358 340 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 VGLL4Q14135 290 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 FHL2Q14192 279 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 ALDH1L2Q3SY69 923 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 FAM83AQ86UY5 434 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 ERO1BQ86YB8 467 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 KAZALD1Q96I82 304 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 PHF20Q9BVI0 1012 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 ABCF2Q9UG63 623 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 PRKAG3Q9UGI9 489 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 DENND2AQ9ULE3 1009 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 PTPN22Q9Y2R2 807 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 UTYO14607 1347 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 BTBD19C9JJ37 291 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 NPIPB8E9PQR5 432 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 LDHCP07864 332 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 GNAI3P08754 354 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 COL6A1P12109 1028 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 FAHP16930 419 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 GRK2P25098 689 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 GRK3P35626 688 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 IL15P40933 162 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 RAC3P60763 192 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 TIMM10P62072 90 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 PPP2R2AP63151 447 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 MAP4K2Q12851 820 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-240ENST00000556339 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms