RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 EFNA5P52803 228 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 KRT79Q5XKE5 535 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 SLC27A1Q6PCB7 646 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 LILRA6Q6PI73 481 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 C1orf210Q8IVY1 113 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 KIAA2013Q8IYS2 634 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 SNX29Q8TEQ0 813 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 BSNDQ8WZ55 320 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 CCDC113Q9H0I3 377 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 BHMT2Q9H2M3 363 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 ARHGEF3Q9NR81 526 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 DLL3Q9NYJ7 618 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 KIAA1024Q9UPX6 916 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 DNM3Q9UQ16 869 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 GIT1Q9Y2X7 761 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-221ENST00000550734 CACNA1BQ00975 2339 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 ARL5CA6NH57 179 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 LRRIQ4A6NIV6 560 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 ACKR2O00590 384 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 DCNP07585 359 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 GLULP15104 373 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 OR1G1P47890 313 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 STARD6P59095 220 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 HTR4Q13639 388 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 MAPK6Q16659 721 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 BRAPQ7Z569 592 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 HACE1Q8IYU2 909 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 SUMF1Q8NBK3 374 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 RUBCNQ92622 972 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 BORCS6Q96GS4 357 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 CPB2Q96IY4 423 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 PRKD2Q9BZL6 878 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 RNF39Q9H2S5 420 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 C17orf75Q9HAS0 396 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 MIOSQ9NXC5 875 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 FNIP2Q9P278 1114 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 DOCK6Q96HP0 2047 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 TPRP12270 2363 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 MIA3Q5JRA6 1907 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 B4GALT5O43286 388 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 TGM5O43548 720 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 BMP15O95972 392 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 SPATA31D3P0C874 917 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 PDCP20941 246 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 RFX1P22670 979 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 ZNF528Q3MIS6 628 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 SPECC1Q5M775 1068 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 MAEAQ7L5Y9 396 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 GSTCDQ8NEC7 633 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 PJA1Q8NG27 643 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 IFT74Q96LB3 600 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 AK8Q96MA6 479 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 GAD1Q99259 594 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 TIPINQ9BVW5 301 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP12.69□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 MYH15Q9Y2K3 1946 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 PP2D1A8MPX8 630 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 E9PMD0 336 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 F8W810 466 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 N4BP3O15049 544 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 NR1I2O75469 434 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 GUCY2CP25092 1073 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 CDC25AP30304 524 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 USP41Q3LFD5 358 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 RINT1Q6NUQ1 792 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 C1orf186Q6ZWK4 172 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 PALB2Q86YC2 1186 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 DAW1Q8N136 415 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 DEPTORQ8TB45 409 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 KCNN1Q92952 543 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 ZFP42Q96MM3 310 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 COLEC11Q9BWP8 271 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 GPR62Q9BZJ7 368 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 PIDD1Q9HB75 910 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 KCND2Q9NZV8 630 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 KCNG1Q9UIX4 513 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 HES2Q9Y543 173 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 NUMBLQ9Y6R0 609 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 PATJQ8NI35 1801 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 ACACBO00763 2458 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-221ENST00000550734 TTLL13PA6NNM8 815 aa12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms