RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538266.5

SNHG1-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3 BASIC

Gene SNHG1, Length 347 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-208	ENST00000538266	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	MTMR8	Q96EF0	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	MMP19	Q99542	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	GBP3	Q9H0R5	595 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PORCN	Q9H237	461 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF536	O15090	1300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	MGAM	O43451	1857 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266		B4DLN1	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	NFIB	O00712	420 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	GJB6	O95452	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CFB	P00751	764 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SYP	P08247	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	POLR2M	P0CAP2	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CALML3	P27482	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ADORA2A	P29274	412 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	GNA11	P29992	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	RGS2	P41220	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ADCY7	P51828	1080 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	NLRP5	P59047	1200 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	NTRK3	Q16288	839 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	DPP9	Q86TI2	863 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	RAET1E	Q8TD07	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SNX21	Q969T3	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ARMC5	Q96C12	935 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	MAF1	Q9H063	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	C6orf50	Q9HD87	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	WHRN	Q9P202	907 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	RIPK3	Q9Y572	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	TRIM17	Q9Y577	477 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	ESYT2	A0FGR8	921 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	SMCO2	A6NFE2	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266		H3BQV1	296 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	STXBP3	O00186	592 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	JAK2	O60674	1132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	GSN	P06396	782 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PGK2	P07205	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	PDC	P20941	246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG1-208	ENST00000538266	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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