RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 BHMT2Q9H2M3 363 aa26.45■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 LRWD1Q9UFC0 647 aa26.45■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 DMDP11532 3685 aa26.44■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 MYBP10242 640 aa26.44■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 SRFP11831 508 aa26.44■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 LAMP2P13473 410 aa26.44■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 HOXA9P31269 272 aa26.44■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 PSMD5Q16401 504 aa26.44■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 EEF1DP3Q658K8 133 aa26.44■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 SIX5Q8N196 739 aa26.44■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 FAM184AQ8NB25 1140 aa26.44■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 HASPINQ8TF76 798 aa26.44■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 CXCL16Q9H2A7 254 aa26.44■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 ANHXE9PGG2 379 aa26.43■■□□□ 1.82
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ACER3-211ENST00000531461 NT5DC1Q5TFE4 455 aa26.43■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 ATF7IP2Q5U623 682 aa26.43■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 CCDC105Q8IYK2 499 aa26.43■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 RSAD2Q8WXG1 361 aa26.43■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 RAB34Q9BZG1 259 aa26.43■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 KIAA1024Q9UPX6 916 aa26.43■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 PI15O43692 258 aa26.42■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 POU2F2P09086 479 aa26.42■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 KIFC3Q9BVG8 833 aa26.42■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 TNFSF13BQ9Y275 285 aa26.42■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 USP20Q9Y2K6 914 aa26.42■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 K7ERI5 159 aa26.41■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 LAD1O00515 517 aa26.41■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 FGFR3P22607 806 aa26.41■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 LIN9Q5TKA1 542 aa26.41■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 RTL10Q7L3V2 364 aa26.41■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 CEP57Q86XR8 500 aa26.41■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 UROC1Q96N76 676 aa26.41■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 KIF2CQ99661 725 aa26.41■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 GDAQ9Y2T3 454 aa26.41■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa26.4■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 FAM186AA6NE01 2351 aa26.4■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 LIG1P18858 919 aa26.4■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 PTGDRQ13258 359 aa26.4■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 HTR4Q13639 388 aa26.4■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 RAB33AQ14088 237 aa26.4■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 UVSSAQ2YD98 709 aa26.4■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa26.4■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 TMEM134Q9H6X4 195 aa26.4■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 CITO14578 2027 aa26.39■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 KRBA1A5PL33 1030 aa26.39■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 CFHP08603 1231 aa26.39■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 FSHRP23945 695 aa26.39■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 PRPHP41219 470 aa26.39■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 NBR1Q14596 966 aa26.39■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 XKR4Q5GH76 650 aa26.39■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 SNX29Q8TEQ0 813 aa26.39■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 PTPRHQ9HD43 1115 aa26.39■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa26.39■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 MTRRQ9UBK8 725 aa26.39■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 DNM3Q9UQ16 869 aa26.39■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 B3GAT3O94766 335 aa26.38■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 C8AP07357 584 aa26.38■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 GRM5P41594 1212 aa26.38■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 NPTX2P47972 431 aa26.38■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 UPP1Q16831 310 aa26.38■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 PPM1LQ5SGD2 360 aa26.38■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 ALKAL1Q6UXT8 129 aa26.38■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 DTWD2Q8NBA8 298 aa26.38■■□□□ 1.81
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ACER3-211ENST00000531461 C17orf75Q9HAS0 396 aa26.38■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 POLD4Q9HCU8 107 aa26.38■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa26.38■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa26.38■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 NOTCH4Q99466 2003 aa26.38■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.37■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 PRR23AA6NEV1 266 aa26.37■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 ADAM12O43184 909 aa26.37■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 TRAPPC3O43617 180 aa26.37■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 XYLBO75191 536 aa26.37■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 CLCNKBP51801 687 aa26.37■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 KRT79Q5XKE5 535 aa26.37■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa26.37■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 CD300LGQ6UXG3 332 aa26.37■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 ASCL5Q7RTU5 278 aa26.37■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 DAW1Q8N136 415 aa26.37■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 CDH7Q9ULB5 785 aa26.37■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 BACE2Q9Y5Z0 518 aa26.37■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa26.36■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 PEX3P56589 373 aa26.36■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
ACER3-211ENST00000531461 GLRA4Q5JXX5 417 aa26.36■■□□□ 1.81
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