RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531184.5

GSDMD-211, Transcript of gasdermin D, humanhuman

TSL 2

Gene GSDMD, Length 2,213 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMD-211ENST00000531184 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 ARL10Q8N8L6 244 aa22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 DYDC2Q96IM9 177 aa22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 MIPEPQ99797 713 aa22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 TMEM247A6NEH6 219 aa22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 MAGEB2O15479 319 aa22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 FGFR4P22455 802 aa22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 DSG1Q02413 1049 aa22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 MPP2Q14168 576 aa22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 PRDM1O75626 825 aa22.09■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 VCAM1P19320 739 aa22.09■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.09■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 OLFML1Q6UWY5 402 aa22.09■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa22.09■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.09■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa22.09■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 BRAFP15056 766 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 SERPINB8P50452 374 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 MAPK7Q13164 816 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 TRIM9Q9C026 710 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 STK24Q9Y6E0 443 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 PFASO15067 1338 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 PRDX5P30044 214 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 MAP3K10Q02779 954 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 FUT2Q10981 343 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 UBE3CQ15386 1083 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 CLUL1Q15846 466 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 ABHD8Q96I13 439 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 BTBD7Q9P203 1132 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 NR2E1Q9Y466 385 aa22.08■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 CCDC22O60826 627 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 FCER1AP12319 257 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 PORP16435 677 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 FOXN2P32314 431 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 TXKP42681 527 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 SCNN1DP51172 638 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 ASIC2Q16515 512 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 ACAD11Q709F0 780 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 GMLQ99445 158 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 ECSITQ9BQ95 431 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 SIKE1Q9BRV8 207 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 FAM196BA6NMK8 535 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 STRNO43815 780 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 NPEPPSP55786 919 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 IL9RQ01113 521 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 LONRF1Q17RB8 773 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 A8MXQ7 604 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 CRABP2P29373 138 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 EMP3P54852 163 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 MTTPP55157 894 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 ADCY1Q08828 1119 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 PTPROQ16827 1216 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 GLG1Q92896 1179 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 BTBD10Q9BSF8 475 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 ZWINTO95229 277 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 CPA3P15088 417 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 UBA7P41226 1012 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 GRM2Q14416 872 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 ADRM1Q16186 407 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 IZUMO2Q6UXV1 221 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 ERMNQ8TAM6 284 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.06■■□□□ 1.12
GSDMD-211ENST00000531184 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms