RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530120.5

CSRP1-213, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 4

Gene CSRP1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-213	ENST00000530120	USP24	Q9UPU5	2620 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	N4BP3	O15049	544 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	JAK2	O60674	1132 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	RFPL2	O75678	378 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	OR52Z1	P0C646	297 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	LAMP2	P13473	410 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	RPA1	P27694	616 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	SCNN1G	P51170	649 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	STARD6	P59095	220 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	NFKBIB	Q15653	356 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	CHST7	Q9NS84	486 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	FNIP2	Q9P278	1114 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	TEX28	O15482	410 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	LRRN2	O75325	713 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	GLUL	P15104	373 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	MCM7	P33993	719 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	NAMPT	P43490	491 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	HTR4	Q13639	388 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	C8orf76	Q96K31	380 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	ZFP42	Q96MM3	310 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	ANHX	E9PGG2	379 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	WNT7A	O00755	349 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	NPTXR	O95502	500 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	MAGEA9	P43362	315 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	EFNA5	P52803	228 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	TUSC3	Q13454	348 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	MAPK6	Q16659	721 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	RAB34	Q9BZG1	259 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	FZD8	Q9H461	694 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	HES2	Q9Y543	173 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	B4GALT5	O43286	388 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	ADRB1	P08588	477 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	CYP11B2	P19099	503 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	FSHR	P23945	695 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	GPC5	P78333	572 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	PRKCQ	Q04759	706 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	PADI6	Q6TGC4	694 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	KIFAP3	Q92845	792 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	IFT74	Q96LB3	600 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	APOL6	Q9BWW8	343 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	EPC1	Q9H2F5	836 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSRP1-213	ENST00000530120	RAB23	Q9ULC3	237 aa		13.21	□□□□□ -0.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms