RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	INCENP	Q9NQS7	918 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	IPP	Q9Y573	584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	MATN2	O00339	956 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ZBED1	O96006	694 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	PFKM	P08237	780 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	AKAP5	P24588	427 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ECE1	P42892	770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ROM1	Q03395	351 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	GRM7	Q14831	915 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	STIL	Q15468	1287 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CT83	Q5H943	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	JADE3	Q92613	823 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP27B1	O15528	508 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	RAMP2	O60895	175 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	OSM	P13725	252 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC5A1	P13866	664 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	AGXT	P21549	392 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	MEOX1	P50221	254 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	RENBP	P51606	427 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	DUSP8	Q13202	625 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	PDILT	Q8N807	584 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CCT6B	Q92526	530 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	TBCB	Q99426	244 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	PRRX2	Q99811	253 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	LPL	P06858	475 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	TYRP1	P17643	537 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	ADCY8	P40145	1251 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM193A	P78312	1265 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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