RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518916.5

MSC-AS1-204, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 864 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-204ENST00000518916 PLEKHO2Q8TD55 490 aa15.98■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 TOX2Q96NM4 488 aa15.98■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 ACAP3Q96P50 834 aa15.98■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 PDE11AQ9HCR9 933 aa15.98■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa15.98■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 SIK3Q9Y2K2 1263 aa15.98■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 NRDCO43847 1150 aa15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 EVI5O60447 810 aa15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 CXCL8P10145 99 aa15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 PPP3CAQ08209 521 aa15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 BIRC3Q13489 604 aa15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 CBWD6Q4V339 395 aa15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 CBWD3Q5JTY5 395 aa15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 CBWD5Q5RIA9 395 aa15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 KRT39Q6A163 491 aa15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 CNGA4Q8IV77 575 aa15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 CD302Q8IX05 232 aa15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 CRACR2AQ9BSW2 395 aa15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 HIPK3Q9H422 1215 aa15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 PADI3Q9ULW8 664 aa15.97■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 PMM2O15305 246 aa15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 PARNO95453 639 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 TNNC2P02585 160 aa15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 TMEM191BP0C7N4 346 aa15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 PIK3CAP42336 1068 aa15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 RAB27AP51159 221 aa15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 CLDN10P78369 228 aa15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 TLE2Q04725 743 aa15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 FIGNQ5HY92 759 aa15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 C1orf220Q5T0J3 134 aa15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 CCDC186Q7Z3E2 898 aa15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 TMEM117Q9H0C3 514 aa15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 ASB7Q9H672 318 aa15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa15.96■□□□□ 0.15
MSC-AS1-204ENST00000518916 CITO14578 2027 aa15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 ANK1P16157 1881 aa15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 PHACTR2O75167 634 aa15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 CLSTN1O94985 981 aa15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 GYPCP04921 128 aa15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 SKIP12755 728 aa15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 KLK7P49862 253 aa15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TMEM192Q8IY95 271 aa15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 FBXL13Q8NEE6 735 aa15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 APOL6Q9BWW8 343 aa15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 PLCB1Q9NQ66 1216 aa15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 IPPQ9Y573 584 aa15.95■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 A0A1W2PQJ5 194 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 MFAP3LO75121 409 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 RECQL4O94761 1208 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 CLTBP09497 229 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 RFX1P22670 979 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 PON1P27169 355 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAAP100Q0VG06 881 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 KCNMA1Q12791 1236 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TMEM132DQ14C87 1099 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 DUOXA2Q1HG44 320 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 LRRC26Q2I0M4 334 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 EPC2Q52LR7 807 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 UBXN11Q5T124 520 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRIM65Q6PJ69 517 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRAF7Q6Q0C0 670 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 SV2AQ7L0J3 742 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 NT5DC4Q86YG4 428 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 CPLX3Q8WVH0 158 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 SNX27Q96L92 541 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 FTHL17Q9BXU8 183 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 EDEM3Q9BZQ6 932 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 IMPG2Q9BZV3 1241 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAM105AQ9NUU6 356 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 SNTG2Q9NY99 539 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 CEP72Q9P209 647 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 PARP2Q9UGN5 583 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa15.94■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 A0A1W2PPC1 479 aa15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TTC26A0AVF1 554 aa15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 LACTBL1A8MY62 500 aa15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 CASP14P31944 242 aa15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 BMP8BP34820 402 aa15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 WNT7BP56706 349 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms