RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa7.7□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAK2O60296 914 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM189A1O60320 539 aa7.69□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa7.67□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 K7ENM7 598 aa7.67□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 TOM1L1O75674 476 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF4AO95239 1232 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 PIGRP01833 764 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 SOD2P04179 222 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 CNPP09543 421 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 MCF2P10911 925 aa7.67□□□□□ -1.18
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