RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 KLRC4O43908 158 aa20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 PRR29P0C7W0 189 aa20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 CXCL8P10145 99 aa20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 DNAJB1P25685 340 aa20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 PSMD2Q13200 908 aa20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 CNTN3Q9P232 1028 aa20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.06■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 BRWD1Q9NSI6 2320 aa20.05■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.05■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 TISP43B9A030 160 aa20.05■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 GARTP22102 1010 aa20.05■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.05■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 DPYDQ12882 1025 aa20.05■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 XKR4Q5GH76 650 aa20.05■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.05■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.05■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.05■□□□□ 0.8
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DDR1-241ENST00000460944 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.05■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.04■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 KINO60870 393 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 KCNE1P15382 129 aa20.04■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 TNFSF9P41273 254 aa20.04■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 CAMK1Q14012 370 aa20.04■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.04■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.04■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.04■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 TMC7Q7Z402 723 aa20.04■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 TIGD1Q96MW7 591 aa20.04■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 TCF25Q9BQ70 676 aa20.04■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 FAM189A1O60320 539 aa20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 ADSSP30520 456 aa20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 CA8P35219 290 aa20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 IRS1P35568 1242 aa20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 UBE2HP62256 183 aa20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
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DDR1-241ENST00000460944 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 CD302Q8IX05 232 aa20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 VPS52Q8N1B4 723 aa20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 UROC1Q96N76 676 aa20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 MARCH5Q9NX47 278 aa20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 COL6A3P12111 3177 aa20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 FSCN2O14926 492 aa20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 RHOBTB3O94955 611 aa20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 KIF20AO95235 890 aa20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 ACOT2P49753 483 aa20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 ERVFC1P60507 584 aa20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 STK4Q13043 487 aa20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 KCNB1Q14721 858 aa20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 NAB2Q15742 525 aa20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 FAM212AQ96EL1 285 aa20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 KIF12Q96FN5 646 aa20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 ANK1P16157 1881 aa20.02■□□□□ 0.8
DDR1-241ENST00000460944 TTC26A0AVF1 554 aa20.01■□□□□ 0.79
DDR1-241ENST00000460944 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
DDR1-241ENST00000460944 TADA2AO75478 443 aa20.01■□□□□ 0.79
DDR1-241ENST00000460944 SMC2O95347 1197 aa20.01■□□□□ 0.79
DDR1-241ENST00000460944 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
DDR1-241ENST00000460944 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
DDR1-241ENST00000460944 PNOCQ13519 176 aa20.01■□□□□ 0.79
DDR1-241ENST00000460944 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.01■□□□□ 0.79
DDR1-241ENST00000460944 SAAL1Q96ER3 474 aa20.01■□□□□ 0.79
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