RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 FIBCD1Q8N539 461 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 ACAP3Q96P50 834 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 HAPLN2Q9GZV7 340 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 GDAQ9Y2T3 454 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 INPPL1O15357 1258 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 RECQL4O94761 1208 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 CLTAP09496 248 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 ADSSP30520 456 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 GATMP50440 423 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIML1Q8N9V2 468 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 IKZF4Q9H2S9 585 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 NLRC5Q86WI3 1866 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 ARL5CA6NH57 179 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 TISP43B9A030 160 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 TGFB1I1O43294 461 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 LDHAP00338 332 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R2P41236 205 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 PTPROQ16827 1216 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 EPC2Q52LR7 807 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 ARMCX5Q6P1M9 558 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC43Q8N309 656 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 CEP120Q8N960 986 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 GAD1Q99259 594 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 PDXKO00764 312 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 MLH1P40692 756 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 OSTNP61366 133 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 STIM1Q13586 685 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 MORC3Q14149 939 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 C12orf56Q8IXR9 622 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 RPS6KC1Q96S38 1066 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 KLK14Q9P0G3 267 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 RWDD3Q9Y3V2 267 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 H3BNC9 293 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 BIN1O00499 593 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 CALUO43852 315 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM189A1O60320 539 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 PRCPP42785 496 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC173Q0VFZ6 552 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 LEXMQ3ZCV2 418 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 TIGD5Q53EQ6 642 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 ISM2Q6H9L7 571 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM192Q8IY95 271 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 CBWD1Q9BRT8 395 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 KCTD10Q9H3F6 313 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 KIAA1586Q9HCI6 787 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 CARNS1A5YM72 827 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 EXTL3O43909 919 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 GPM6BQ13491 265 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 MYBPC2Q14324 1141 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 SEZ6Q53EL9 994 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 XKR4Q5GH76 650 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC183Q5T5S1 534 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 ALKAL1Q6UXT8 129 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC55Q6ZSA7 311 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM174Q8WUU8 243 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFP42Q96MM3 310 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R9BQ96SB3 815 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 TSPAN18Q96SJ8 248 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 PCIF1Q9H4Z3 704 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 AAASQ9NRG9 546 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 TBC1D13Q9NVG8 400 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 NCOR1O75376 2440 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 CLIC2O15247 247 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 POMCP01189 267 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 TNFSF9P41273 254 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 ACOT2P49753 483 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 SCNN1GP51170 649 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 GRIK3Q13003 919 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC10A6Q3KNW5 377 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 CD302Q8IX05 232 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 ADSSL1Q8N142 457 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 GPD1LQ8N335 351 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-205ENST00000450873 GSTCDQ8NEC7 633 aa11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms