RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 CDT1Q9H211 546 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC169A6NNP5 214 aa22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 AVPR2P30518 371 aa22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 TCF15Q12870 199 aa22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 CLUHO75153 1309 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 ABLIM1O14639 778 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 CREMQ03060 361 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 DRC1Q96MC2 740 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 TTPALQ9BTX7 342 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 SFI1A8K8P3 1242 aa22.09■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.09■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 PROZP22891 400 aa22.09■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 GUCY2CP25092 1073 aa22.09■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 GRM5P41594 1212 aa22.09■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 PSMD5Q16401 504 aa22.09■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 XKR4Q5GH76 650 aa22.09■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.09■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 PRRX2Q99811 253 aa22.09■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.09■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 KCNK12Q9HB15 430 aa22.09■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.09■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.09■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 ADAM12O43184 909 aa22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 ZMYND10O75800 440 aa22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 MRE11P49959 708 aa22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 CLCNKBP51801 687 aa22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 PTPN5P54829 565 aa22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 CEP57Q86XR8 500 aa22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 MYADMQ96S97 322 aa22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 PHOX2BQ99453 314 aa22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 TIPINQ9BVW5 301 aa22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 PRKD2Q9BZL6 878 aa22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.08■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.07■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 H3BQV1 296 aa22.07■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 SLC16A4O15374 487 aa22.07■■□□□ 1.12
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HLA-B-250ENST00000434333 FGFR3P22607 806 aa22.07■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 MCM2P49736 904 aa22.07■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 SLC12A3P55017 1021 aa22.07■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 TDGQ13569 410 aa22.07■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 UPP1Q16831 310 aa22.07■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.07■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.07■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 PLIN2Q99541 437 aa22.07■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.07■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 OSTNP61366 133 aa22.06■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.06■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.06■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.06■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.06■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 STAMQ92783 540 aa22.06■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.06■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.06■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 MYH11P35749 1972 aa22.06■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.06■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 B3GAT3O94766 335 aa22.05■■□□□ 1.12
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HLA-B-250ENST00000434333 PLS3P13797 630 aa22.05■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.05■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.05■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 LRRC15Q8TF66 581 aa22.05■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.05■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 SNX27Q96L92 541 aa22.05■■□□□ 1.12
HLA-B-250ENST00000434333 UROC1Q96N76 676 aa22.05■■□□□ 1.12
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