RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 FEM1BQ9UK73 627 aa20.01■□□□□ 0.79
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SH3BP1-202ENST00000417536 CLEC4DQ8WXI8 215 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM109Q9BVC6 243 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
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SH3BP1-202ENST00000417536 BACE1P56817 501 aa19.96■□□□□ 0.79
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