RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CLEC1BQ9P126 229 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNH3Q9ULD8 1083 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 IRAK3Q9Y616 596 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 FSD2A1L4K1 749 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 TBX10O75333 385 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 EFEMP2O95967 443 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CMA1P23946 247 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 NUCB2P80303 420 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC10A6Q3KNW5 377 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 VN1R2Q8NFZ6 395 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 STRA6Q9BX79 667 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAM28Q9UKQ2 775 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 GRXCR2A6NFK2 248 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD63C9JTQ0 380 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 LILRB3O75022 631 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 GLP2RO95838 553 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CLTAP09496 248 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNC3Q14003 757 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CLUL1Q15846 466 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC39A4Q6P5W5 647 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 SNX27Q96L92 541 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 C7orf25Q9BPX7 421 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR62Q9BZJ7 368 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM9Q9C026 710 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 OLFML3Q9NRN5 406 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0B4J269 797 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R37O75864 691 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 GCNT3O95395 438 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNE1P15382 129 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPN14Q15678 1187 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 KYAT1Q16773 422 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 LLGL2Q6P1M3 1020 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 FUT10Q6P4F1 479 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 HVCN1Q96D96 273 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 MSLNLQ96KJ4 702 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 MAGEF1Q9HAY2 307 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CNTN3Q9P232 1028 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CD207Q9UJ71 328 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1B0GVL5 298 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 C2CD2LO14523 706 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 OGTO15294 1046 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 MYBP10242 640 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNA1Q09470 495 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA0319Q5VV43 1072 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 SLFN12LQ6IEE8 588 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA1841Q6NSI8 718 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 KLHL5Q96PQ7 755 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 ACCSQ96QU6 501 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 MSTO1Q9BUK6 570 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CHST7Q9NS84 486 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC38A7Q9NVC3 462 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF4AO95239 1232 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 URODP06132 367 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFSF9P41273 254 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CLCNKBP51801 687 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CASP5P51878 434 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 ASIC1P78348 528 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 COASYQ13057 564 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 USP41Q3LFD5 358 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP57L1Q8IYX8 460 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 HASPINQ8TF76 798 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 UROC1Q96N76 676 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 IKZF4Q9H2S9 585 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 STYXL1Q9Y6J8 313 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-204ENST00000416021 VCANP13611 3396 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 TISP43B9A030 160 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM189A1O60320 539 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4-204ENST00000416021 B3GAT3O94766 335 aa23.01■■□□□ 1.27
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