RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 COMTP21964 271 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 FLT3P36888 993 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 PDE6CP51160 858 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 HUNKP57058 714 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 CYP24A1Q07973 514 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 MICALCLQ6ZW33 695 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 OTUD5Q96G74 571 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 PLVAPQ9BX97 442 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 TRPC6Q9Y210 931 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 TRIM66O15016 1216 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 CYP26A1O43174 497 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 NR3C2P08235 984 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 PAEPP09466 180 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ACAD10Q6JQN1 1059 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ZNF677Q86XU0 584 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 PRELID2Q8N945 189 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 KAT5Q92993 513 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 OPTNQ96CV9 577 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 C12orf42Q96LP6 360 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ERVK-5Q9HDB9 667 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 CEP350Q5VT06 3117 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 PSAPP07602 524 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 USP8P40818 1118 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 CLDN10P78369 228 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 MTMR2Q13614 643 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 PLA2G4FQ68DD2 849 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 HOOK3Q86VS8 718 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ERO1BQ86YB8 467 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 GPD1LQ8N335 351 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 TRIM51Q9BSJ1 452 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 DPH5Q9H2P9 285 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 RNF146Q9NTX7 359 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 FAM169AQ9Y6X4 670 aa25.51■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ARID2Q68CP9 1835 aa25.5■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ATP2A1O14983 1001 aa25.5■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 FNTAP49354 379 aa25.5■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 SLC47A2Q86VL8 602 aa25.5■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 REPS2Q8NFH8 660 aa25.5■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 SLCO2A1Q92959 643 aa25.5■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.5■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.5■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA8IPA6NC78 632 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA8JA6NMD2 632 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 FAM107AO95990 144 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 KCNA2P16389 499 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 BACE1P56817 501 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 PPP2R2AP63151 447 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 GUCY1A3Q02108 690 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 MESDQ14696 234 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 SLC39A4Q6P5W5 647 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 NSMFQ6X4W1 530 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 KRT35Q92764 455 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 TRIM11Q96F44 468 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 CEP170P1Q96L14 293 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 NUP85Q9BW27 656 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 WDR81Q562E7 1941 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 TMEM150BA6NC51 233 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 MMEP08473 750 aa25.49■■□□□ 1.67
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PMS1-205ENST00000409985 CDR1P51861 262 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 NAA35Q5VZE5 725 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
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PMS1-205ENST00000409985 TMEM109Q9BVC6 243 aa25.49■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
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PMS1-205ENST00000409985 RWDD2BP57060 319 aa25.48■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 BPIFB4P59827 614 aa25.48■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 SMYD5Q6GMV2 418 aa25.48■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 SV2AQ7L0J3 742 aa25.48■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 POMGNT1Q8WZA1 660 aa25.48■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa25.48■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 GABBR1Q9UBS5 961 aa25.48■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 ZDHHC24Q6UX98 284 aa25.47■■□□□ 1.67
PMS1-205ENST00000409985 NLRP14Q86W24 1093 aa25.47■■□□□ 1.67
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