RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 CYP2A13Q16696 494 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 CHTF18Q8WVB6 975 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 SARAFQ96BY9 339 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 TIMP4Q99727 224 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 HEPHQ9BQS7 1158 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 TP73O15350 636 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 CTSSP25774 331 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 FLT3P36888 993 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 CFAP100Q494V2 611 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 FAM47AQ5JRC9 791 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 FAM43AQ8N2R8 423 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 LILRB2Q8N423 598 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 LNX2Q8N448 690 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 REPS2Q8NFH8 660 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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PTPRC-202ENST00000367364 AATKQ6ZMQ8 1374 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM38O00635 465 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 CRHR1P34998 444 aa5.98□□□□□ -1.45
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PTPRC-202ENST00000367364 DSG1Q02413 1049 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 GPR158Q5T848 1215 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 NXPE1Q8N323 547 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 HASPINQ8TF76 798 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 F2P00734 622 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 WT1P19544 449 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 VAV2P52735 878 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 MANFP55145 182 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 RAP2BP61225 183 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 HSD11B2P80365 405 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 C11orf87Q6NUJ2 197 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF480Q8WV37 535 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 USP25Q9UHP3 1055 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 ATRNL1Q5VV63 1379 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 PRSS23O95084 383 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 ATP2B1P20020 1258 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 GCSHP23434 173 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 THNSL2Q86YJ6 484 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 PASD1Q8IV76 773 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 OR14C36Q8NHC7 312 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 IFT57Q9NWB7 429 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 DMTF1Q9Y222 760 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 GPANK1O95872 356 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 GPD1P21695 349 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 PHC1P78364 1004 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRC-202ENST00000367364 KIAA0895LQ68EN5 471 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
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PTPRC-202ENST00000367364 RSAD2Q8WXG1 361 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 ANO3Q9BYT9 981 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 TANGO6Q9C0B7 1094 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 SIK3Q9Y2K2 1263 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 CDY2AQ9Y6F7 541 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF804BA4D1E1 1349 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 AOX1Q06278 1338 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 GAS7O60861 476 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 PRKCGP05129 697 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV2-30P06310 120 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 PTPN7P35236 360 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 KLHL22Q53GT1 634 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 KIF18BQ86Y91 864 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 ELFN1P0C7U0 828 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 FOLR3P41439 243 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 MAPK10P53779 464 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 MST1LQ2TV78 715 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 NAALADL2Q58DX5 795 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 DRC7Q8IY82 874 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 MKL1Q969V6 931 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 WNT8AQ9H1J5 351 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 IGSF5Q9NSI5 407 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 FAM83GA6ND36 823 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 PEX1O43933 1283 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 SLC6A2P23975 617 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 RBL2Q08999 1139 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 GEN1Q17RS7 908 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-202ENST00000367364 MTX3Q5HYI7 312 aa5.92□□□□□ -1.46
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