RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 GNALP38405 381 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP2K6P52564 334 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTXN1P60606 82 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP8B2P98198 1209 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 HHEXQ03014 270 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CREMQ03060 361 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 TLE1Q04724 770 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXL1Q12952 345 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOGQ13253 232 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 GBX1Q14549 363 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRM3Q14832 879 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM47AQ5JRC9 791 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP4R4Q6NUP7 873 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 DOK3Q7L591 496 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 DGKHQ86XP1 1220 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD35Q8N283 1001 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 MB21D1Q8N884 522 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP1R35Q8TAP8 253 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ST8SIA2Q92186 375 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 BORCS6Q96GS4 357 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CGRRF1Q99675 332 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 LMBRD1Q9NUN5 540 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 NR2E3Q9Y5X4 410 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATRNL1Q5VV63 1379 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAPN14A8MX76 684 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 PATE3B3GLJ2 98 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 B3GALT2O43825 422 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 MFAP3LO75121 409 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBXN7O94888 489 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 MALP21145 153 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 COMTP21964 271 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 HTR1BP28222 390 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 HK3P52790 923 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAP2BP61225 183 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 HS1BP3Q53T59 392 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF529Q6P280 563 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC4A10Q6U841 1118 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEM1Q6ZVN7 128 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTLL10Q6ZVT0 673 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 OVCH2Q7RTZ1 564 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 DAAM2Q86T65 1068 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM83AQ86UY5 434 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 XYLT1Q86Y38 959 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLXDC1Q8IUK5 500 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHDC4Q8TBB5 520 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 TFAP2CQ92754 450 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM89AQ96GI7 184 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM167AQ96KS9 214 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRI1Q9BV20 369 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 B3GNT5Q9BYG0 378 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNH6Q9H252 994 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM60Q9H2L4 133 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 GABBR1Q9UBS5 961 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABCF2Q9UG63 623 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLCA2Q9UQC9 943 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 K7ESM1 405 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 WNT10BO00744 389 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRM6O15303 877 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP27B1O15528 508 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF623O75123 536 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAND2O75155 1236 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 TUSC2O75896 110 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT18P05783 430 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 FTH1P19P0C7X4 201 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALAS1P13196 640 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLRN1P58418 232 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 DACT2Q5SW24 774 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKS6Q68DC2 871 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 SGMS1Q86VZ5 419 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC146Q8IYE0 955 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF169Q8NCN4 708 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 MDGA1Q8NFP4 955 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNERQ8NFT8 737 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR52N2Q8NGI0 321 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms