RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360286.2

SUDS3-201, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

TSL 5

Gene SUDS3, Length 510 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-201ENST00000360286 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 MTUS1Q9ULD2 1270 aa7□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 UBE4BO95155 1302 aa7□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 LAMA3Q16787 3333 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 ANK1P16157 1881 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 TTC26A0AVF1 554 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 EPOPA6NHQ4 379 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 PDXKO00764 312 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 INPPL1O15357 1258 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 EXTL3O43909 919 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 THP07101 528 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 ADRB2P07550 413 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 GALTP07902 379 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 BMPR1AP36894 532 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 SLC11A1P49279 550 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 CYP2J2P51589 502 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 BCAR1P56945 870 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 ERVK-21P61565 698 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 GRIN2CQ14957 1233 aa6.99□□□□□ -1.29
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SUDS3-201ENST00000360286 EPC2Q52LR7 807 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 XKR4Q5GH76 650 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 KLHL10Q6JEL2 608 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 GPD1LQ8N335 351 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 SNX27Q96L92 541 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 ZNF576Q9H609 170 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 DMAC2Q9NW81 257 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.99□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 NLRC5Q86WI3 1866 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 CASTOR2A6NHX0 329 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 ZNF233A6NK53 670 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 F8W810 466 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 NRP1O14786 923 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 EXOC3O60645 756 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 KIF20AO95235 890 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 NR3C1P04150 777 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 ALDH2P05091 517 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 KCNE1P15382 129 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 CCNE1P24864 410 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 CTNNB1P35222 781 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 OR1G1P47890 313 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 CASP4P49662 377 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 GUCY2FP51841 1108 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 STX17P56962 302 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 NLRP12P59046 1061 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 ADAM9Q13443 819 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 GPM6BQ13491 265 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 NAB2Q15742 525 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 ZBTB6Q15916 424 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 KYAT1Q16773 422 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 CCDC183Q5T5S1 534 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 CEP135Q66GS9 1140 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 JADE1Q6IE81 842 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 CENPPQ6IPU0 288 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 LRRC43Q8N309 656 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 GOLGA5Q8TBA6 731 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 NELFBQ8WX92 580 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 P2RX5Q93086 422 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 KIF12Q96FN5 646 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SUDS3-201ENST00000360286 FAM84AQ96KN4 292 aa6.98□□□□□ -1.29
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