RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 MYPNQ86TC9 1320 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 C19orf81C9J6K1 198 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 PODXLO00592 558 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 CPP00450 1065 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 ICAM3P32942 547 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 ACTR2P61160 394 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 PSMD6Q15008 389 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 H0YCG3 227 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 EXTL3O43909 919 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 ATP4AP20648 1035 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 USP8P40818 1118 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF677Q86XU0 584 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF653Q96CK0 615 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 EBAG9O00559 213 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 FNTAP49354 379 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 WNT7BP56706 349 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 ZACNQ401N2 412 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 C3orf20Q8ND61 904 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 BTBD6Q96KE9 485 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 FAM107BQ9H098 131 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 LRRC19Q9H756 370 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 FAM170AA1A519 330 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 ACAD9Q9H845 621 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 GGA2Q9UJY4 613 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 FSCN2O14926 492 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 TP73O15350 636 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 PPP2R2AP63151 447 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 SP2Q02086 613 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 XKR3Q5GH77 459 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 RARAP10276 462 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 HMGCS2P54868 508 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 CENPCQ03188 943 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 ART4Q93070 314 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4C-201ENST00000317868 PTPRJQ12913 1337 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4C-201ENST00000317868 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4C-201ENST00000317868 FAM107AO95990 144 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4C-201ENST00000317868 PMS2P54278 862 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4C-201ENST00000317868 RWDD2BP57060 319 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4C-201ENST00000317868 EMC2Q15006 297 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4C-201ENST00000317868 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4C-201ENST00000317868 NLRP14Q86W24 1093 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4C-201ENST00000317868 MCOLN2Q8IZK6 566 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms