RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.88■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIAA1586Q9HCI6 787 aa25.88■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SIK3Q9Y2K2 1263 aa25.88■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTPN14Q15678 1187 aa25.87■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UBXN11Q5T124 520 aa25.87■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC27A1Q6PCB7 646 aa25.87■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMTC1Q8IUR5 882 aa25.87■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CXCL16Q9H2A7 254 aa25.87■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PADI3Q9ULW8 664 aa25.87■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A1W2PQJ5 194 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZSCAN12O43309 604 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRN2O75325 713 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STAG3L1P0CL83 205 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CXCL8P10145 99 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TNNT1P13805 278 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FMO5P49326 533 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TLE2Q04725 743 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM130Q8N3G9 435 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF516Q92618 1163 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNAJC7Q99615 494 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ERVK-5Q9HDB9 667 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANK1P16157 1881 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EPHB6O15197 1021 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAAP100Q0VG06 881 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PSMD6Q15008 389 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SCARA3Q6AZY7 606 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BRSK2Q8IWQ3 736 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADPGKQ9BRR6 497 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C11orf49Q9H6J7 331 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa25.86■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRC26Q2I0M4 334 aa25.85■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYP26C1Q6V0L0 522 aa25.85■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa25.85■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANKLE1Q8NAG6 615 aa25.85■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMC2Q8TDI7 906 aa25.85■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa25.85■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SOWAHDA6NJG2 315 aa25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MGEA5O60502 916 aa25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACTN1P12814 892 aa25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EN2P19622 333 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC9A1P19634 815 aa25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AXLP30530 894 aa25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZBED6P86452 979 aa25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM117Q9H0C3 514 aa25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SNTG2Q9NY99 539 aa25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAND2O75155 1236 aa25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPNMBQ14956 572 aa25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRC8DQ7L1W4 858 aa25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ELMO3Q96BJ8 720 aa25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 APOL6Q9BWW8 343 aa25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF19AQ9NV58 838 aa25.84■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYL7Q01449 175 aa25.83■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PAK2Q13177 524 aa25.83■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAD9BQ6WBX8 426 aa25.83■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa25.83■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 REXO1L1PQ8IX06 675 aa25.83■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR5B17Q8NGF7 314 aa25.83■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAGE1Q8TC20 777 aa25.83■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FNBP1Q96RU3 617 aa25.83■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF39Q9H2S5 420 aa25.83■■□□□ 1.73
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MROH7Q68CQ1 1323 aa25.82■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR182O15218 404 aa25.82■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MTF1Q14872 753 aa25.82■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC10A6Q3KNW5 377 aa25.82■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa25.82■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa25.82■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLTAP09496 248 aa25.81■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SELPP16109 830 aa25.81■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TNNI1P19237 187 aa25.81■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AKAP5P24588 427 aa25.81■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GRM5P41594 1212 aa25.81■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa25.81■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EFCAB13Q8IY85 973 aa25.81■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EDEM3Q9BZQ6 932 aa25.81■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GCNT4Q9P109 453 aa25.81■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SCN5AQ14524 2016 aa25.81■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa25.81■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LACTBL1A8MY62 500 aa25.81■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DCDC2CA8MYV0 355 aa25.81■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NBNO60934 754 aa25.81■■□□□ 1.72
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TUBB4AP04350 444 aa25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms