RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Phka2Q8BWJ3 1235 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Taf2Q8C176 1104 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tdrd7Q8K1H1 1086 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 VasnQ9CZT5 673 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 MesdQ9ERE7 224 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rfx5Q9JL61 658 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 1700017N19RikA0A087WPJ1 469 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm15262A0A140LIQ5 728 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc16a6B1AT66 607 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm4846B2RWH8 538 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Aoc3O70423 765 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mark3Q03141 753 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 SPINDOCQ05AH6 381 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 ShbQ6PD21 503 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr23Q7TRX4 325 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Celf4Q7TSY6 486 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tspan18Q80WR1 248 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Frmd3Q8BHD4 595 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Psmd5Q8BJY1 504 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Otud6bQ8K2H2 294 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Klhl36Q8R124 613 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ca9Q8VHB5 437 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Csde1Q91W50 798 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Socs4Q91ZA6 436 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lrrc57Q9D1G5 239 aa17.28■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ptpn3A2ALK8 913 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm12800B1AUV4 484 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm4788E9Q8B5 879 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm12794L7MTS5 483 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gucy1b3O54865 620 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ms4a1P19437 291 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tnnc2P20801 160 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Polr2fP61219 127 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trim72Q1XH17 477 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Phactr1Q2M3X8 580 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Clul1Q3ZRW6 464 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fhod1Q6P9Q4 1197 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 PoliQ6R3M4 717 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cog3Q8CI04 820 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr393Q8VGR6 312 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 FcrlaQ920A9 352 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Chst7Q9EP78 484 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rab27aQ9ERI2 221 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tcirg1Q9JHF5 834 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 PollQ9QXE2 573 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Adam22Q9R1V6 904 aa17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atp6v0a1Q9Z1G4 839 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm13128L7MU96 475 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gna15P30678 374 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pcbp1P60335 356 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kcnq1P97414 668 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zbtb8osQ505B7 168 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trim25Q61510 634 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cyp3a16Q64481 504 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ces5aQ6AW46 575 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Maats1Q8BRC6 783 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Aldh5a1Q8BWF0 523 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hgh1Q8C3I8 393 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam155aQ8CCS2 467 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam160b1Q8CDM8 764 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Phc3Q8CHP6 981 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pcdha9Q91Y11 979 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Asb11Q9CQ31 323 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam133bQ9CVI2 245 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Asah2Q9JHE3 756 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 EmcnQ9R0H2 261 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn2r55G3UWZ4 781 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn2r53L7N473 806 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ano7Q14AT5 859 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nxf2Q4ZGD8 691 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc26a2Q62273 739 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Q6PD19 689 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dmtf1Q8CE22 761 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 AclyQ91V92 1091 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Asb7Q91ZU0 318 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Luc7lQ9CYI4 371 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gtf2h1Q9DBA9 547 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Uchl3Q9JKB1 230 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trpc3Q9QZC1 836 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Efcab12V9GXH0 673 aa17.26■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Scn1aA2APX8 2009 aa17.25■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 506 aa17.25■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zscan4-ps2A0A1C7CYU6 506 aa17.25■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atp2c2A7L9Z8 944 aa17.25■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdk14O35495 469 aa17.25■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Xirp1O70373 1129 aa17.25■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ptgs2Q05769 604 aa17.25■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa17.25■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pdk2Q9JK42 407 aa17.25■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Irx4Q9QY61 515 aa17.25■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Arih2Q9Z1K6 492 aa17.25■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Oaz1P54369 227 aa17.24■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vamp7P70280 220 aa17.24■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Grm2Q14BI2 872 aa17.24■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Snx25Q3ZT31 840 aa17.24■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 MmeQ61391 750 aa17.24■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vps72Q62481 368 aa17.24■□□□□ 0.35
Casq1-201ENSMUST00000003554 Snx19Q6P4T1 997 aa17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.3 ms