RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615959.1

MIR3648-1-201, Transcript of microRNA 3648-1, humanhuman

BASIC

Gene MIR3648-1, Length 180 nt, Biotype miRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR3648-1-201ENST00000615959 RINT1Q6NUQ1 792 aa28.27■■■□□ 2.12
MIR3648-1-201ENST00000615959 GPR65Q8IYL9 337 aa28.27■■■□□ 2.12
MIR3648-1-201ENST00000615959 FEZF2Q8TBJ5 459 aa28.27■■■□□ 2.12
MIR3648-1-201ENST00000615959 SMC3Q9UQE7 1217 aa28.27■■■□□ 2.12
MIR3648-1-201ENST00000615959 ZNF318Q5VUA4 2279 aa28.27■■■□□ 2.12
MIR3648-1-201ENST00000615959 SPDYE4A6NLX3 237 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 HIP1RO75146 1068 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 TADA2AO75478 443 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 THP07101 528 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 NPTX2P47972 431 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 PEX3P56589 373 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 SIGLEC14Q08ET2 396 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 ATF7IP2Q5U623 682 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 C1orf186Q6ZWK4 172 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 KCNK18Q7Z418 384 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 DAW1Q8N136 415 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 B3GALT6Q96L58 329 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 PAAF1Q9BRP4 392 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 RUSC1Q9BVN2 902 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 CXCL16Q9H2A7 254 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 CACNG4Q9UBN1 327 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 USTQ9Y2C2 406 aa28.26■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 CCDC169A6NNP5 214 aa28.25■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 PBXIP1Q96AQ6 731 aa28.25■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 MAN1C1Q9NR34 630 aa28.25■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 GDAQ9Y2T3 454 aa28.25■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 PLXNA3P51805 1871 aa28.25■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 GLUD1P00367 558 aa28.24■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 NAB2Q15742 525 aa28.24■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 HYIQ5T013 277 aa28.24■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa28.24■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 ZBTB33Q86T24 672 aa28.24■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa28.24■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 DRC1Q96MC2 740 aa28.24■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 TMEM134Q9H6X4 195 aa28.24■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP28.24■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 DPP7Q9UHL4 492 aa28.24■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 TNFSF13BQ9Y275 285 aa28.24■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 C2orf16Q68DN1 1984 aa28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 CASTOR2A6NHX0 329 aa28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 C1RP00736 705 aa28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 MAPK7Q13164 816 aa28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 KCTD17Q8N5Z5 321 aa28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 KREMEN2Q8NCW0 462 aa28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 PNMA5Q96PV4 448 aa28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 KCNH6Q9H252 994 aa28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 C17orf75Q9HAS0 396 aa28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 FNIP2Q9P278 1114 aa28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa28.23■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 TRIP11Q15643 1979 aa28.22■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 VWA3AA6NCI4 1184 aa28.22■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa28.22■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 DENND4AQ7Z401 1863 aa28.22■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 PLCD3Q8N3E9 789 aa28.22■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 ASIC4Q96FT7 647 aa28.22■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 TIPINQ9BVW5 301 aa28.22■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 NT5C3AQ9H0P0 336 aa28.22■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 KMT5AQ9NQR1 393 aa28.22■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa28.21■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 GUCY2CP25092 1073 aa28.21■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 TAS1R3Q7RTX0 852 aa28.21■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 PALB2Q86YC2 1186 aa28.21■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 HDAC7Q8WUI4 952 aa28.21■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 PTPRHQ9HD43 1115 aa28.21■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 LIMD1Q9UGP4 676 aa28.21■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 SORCS3Q9UPU3 1222 aa28.21■■■□□ 2.11
MIR3648-1-201ENST00000615959 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa28.2■■■□□ 2.1
MIR3648-1-201ENST00000615959 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa28.2■■■□□ 2.1
MIR3648-1-201ENST00000615959 SFI1A8K8P3 1242 aa28.2■■■□□ 2.1
MIR3648-1-201ENST00000615959 KIF4AO95239 1232 aa28.2■■■□□ 2.1
MIR3648-1-201ENST00000615959 CREMQ03060 361 aa28.2■■■□□ 2.1
MIR3648-1-201ENST00000615959 CCDC149Q6ZUS6 474 aa28.2■■■□□ 2.1
MIR3648-1-201ENST00000615959 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
MIR3648-1-201ENST00000615959 HASPINQ8TF76 798 aa28.2■■■□□ 2.1
MIR3648-1-201ENST00000615959 PLIN2Q99541 437 aa28.2■■■□□ 2.1
MIR3648-1-201ENST00000615959 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
MIR3648-1-201ENST00000615959 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa28.2■■■□□ 2.1
MIR3648-1-201ENST00000615959 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa28.2■■■□□ 2.1
MIR3648-1-201ENST00000615959 TGM5O43548 720 aa28.19■■■□□ 2.1
MIR3648-1-201ENST00000615959 SPATA31D3P0C874 917 aa28.19■■■□□ 2.1
MIR3648-1-201ENST00000615959 MTMR3Q13615 1198 aa28.19■■■□□ 2.1
MIR3648-1-201ENST00000615959 RTP2Q5QGT7 225 aa28.19■■■□□ 2.1
MIR3648-1-201ENST00000615959 LILRA6Q6PI73 481 aa28.19■■■□□ 2.1
MIR3648-1-201ENST00000615959 CYP26C1Q6V0L0 522 aa28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms