RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 ZHX3Q9H4I2 956 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ARFGAP3Q9NP61 516 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 GPRC5BQ9NZH0 403 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ASH2LQ9UBL3 628 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CACNA1FO60840 1977 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 RTL1A6NKG5 1358 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CFAP69A5D8W1 941 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC10BA6NIK2 292 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 RHPN2P1A8MT19 583 aa4.93□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 KPNA5O15131 536 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 NCK2O43639 380 aa4.93□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 TLR5O60602 858 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 PFKMP08237 780 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ZGLP1P0C6A0 271 aa4.93□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 PPM1AP35813 382 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 WASP42768 502 aa4.93□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 RGS3P49796 1198 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 HERVK_113P62684 666 aa4.93□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 KIR3DS1Q14943 382 aa4.93□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR155Q7Z3F1 870 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ITPRIPQ8IWB1 547 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 SPATA5Q8NB90 893 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHDC4Q8TBB5 520 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CCT6BQ92526 530 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA1191Q96A73 305 aa4.93□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MYOTQ9UBF9 498 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 PRSS50Q9UI38 385 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CDC23Q9UJX2 597 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ASB1Q9Y576 335 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 NR2E3Q9Y5X4 410 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa4.93□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa4.92□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 FSTP19883 344 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 TACR1P25103 407 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MAN1A1P33908 653 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 AMPHP49418 695 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP2K6P52564 334 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 HSPA2P54652 639 aa4.92□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 TNFAIP2Q03169 654 aa4.92□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 ADCY2Q08462 1091 aa4.92□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 CHRNA2Q15822 529 aa4.92□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 PLBD2Q8NHP8 589 aa4.92□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 NT5C1BQ96P26 610 aa4.92□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 CERS4Q9HA82 394 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 KMT5AQ9NQR1 393 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 PGAP2Q9UHJ9 254 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CORO2BQ9UQ03 480 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 TNNQ9UQP3 1299 aa4.92□□□□□ -1.62
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