RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	CA3	P07451	260 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	ADRB2	P07550	413 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	MYOG	P15173	224 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	AKAP5	P24588	427 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	GATM	P50440	423 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	LRRC43	Q8N309	656 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	CEP120	Q8N960	986 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	URGCP	Q8TCY9	931 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	TIFA	Q96CG3	184 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	SAMD11	Q96NU1	681 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	APOL6	Q9BWW8	343 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	TRIP11	Q15643	1979 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	LCHN	A4D1U4	455 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	PRCP	P42785	496 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	NFIL3	Q16649	462 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	CD302	Q8IX05	232 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM192	Q8IY95	271 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	ADSSL1	Q8N142	457 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	GAD1	Q99259	594 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	TTC26	A0AVF1	554 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	EXTL3	O43909	919 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	LINC00271	P0C7V0	271 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	BMP6	P22004	513 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	MLH1	P40692	756 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	OSTN	P61366	133 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	ERVK-21	P61565	698 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	TAP1	Q03518	808 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	GRIK3	Q13003	919 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	STIM1	Q13586	685 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	CENPP	Q6IPU0	288 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	GPD1L	Q8N335	351 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	SNX27	Q96L92	541 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	ZFP42	Q96MM3	310 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	CWH43	Q9H720	699 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	CNTN3	Q9P232	1028 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	PTGES	O14684	152 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	CLIC2	O15247	247 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	RB1	P06400	928 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	TH	P07101	528 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	KCNE1	P15382	129 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	LAG3	P18627	525 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	TNFSF9	P41273	254 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	SCNN1G	P51170	649 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	SEZ6	Q53EL9	994 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKN1-208	ENST00000586900	ISM2	Q6H9L7	571 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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