RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567114.5

RPUSD1-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, human

TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD1-208	ENST00000567114	NR1I3	Q14994	352 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RPUSD1-208	ENST00000567114	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RPUSD1-208	ENST00000567114	NDST4	Q9H3R1	872 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RPUSD1-208	ENST00000567114	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
RPUSD1-208	ENST00000567114	CHST12	Q9NRB3	414 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RPUSD1-208	ENST00000567114	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
RPUSD1-208	ENST00000567114	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RPUSD1-208	ENST00000567114	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
RPUSD1-208	ENST00000567114	STAG3L1	P0CL83	205 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RPUSD1-208	ENST00000567114	DLG4	P78352	724 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RPUSD1-208	ENST00000567114	SLC35C1	Q96A29	364 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RPUSD1-208	ENST00000567114	CCDC51	Q96ER9	411 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RPUSD1-208	ENST00000567114	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
RPUSD1-208	ENST00000567114	TBX21	Q9UL17	535 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RPUSD1-208	ENST00000567114	TEX33	O43247	280 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	CCL23	P55773	120 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	UBXN1	Q04323	297 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	KCNH2	Q12809	1159 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	TMEM192	Q8IY95	271 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	INTS13	Q9NVM9	706 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	LGALS16	A8MUM7	142 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	CLTA	P09496	248 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	TRIM49	P0CI25	452 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	TRIM49C	P0CI26	452 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	CYP2C18	P33260	490 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	PTPN21	Q16825	1174 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	USP37	Q86T82	979 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	FAM212A	Q96EL1	285 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	NBN	O60934	754 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	KYAT1	Q16773	422 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	UBXN11	Q5T124	520 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	SCLY	Q96I15	445 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	FNBP1	Q96RU3	617 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	TMX1	Q9H3N1	280 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	HES2	Q9Y543	173 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	ACAP3	Q96P50	834 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	GPNMB	Q14956	572 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	PSMD6	Q15008	389 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	TMC2	Q8TDI7	906 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	CXCL8	P10145	99 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	GRM5	P41594	1212 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	WNT7B	P56706	349 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	ADAM2	Q99965	735 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	SNTG2	Q9NY99	539 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	MGEA5	O60502	916 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	APOL6	Q9BWW8	343 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	TNNI1	P19237	187 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	DRC7	Q8IY82	874 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	IPP	Q9Y573	584 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	GCLM	P48507	274 aa		27.76	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	PPP3CA	Q08209	521 aa		27.76	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	DSC3	Q14574	896 aa		27.76	■■■□□ 2.04
RPUSD1-208	ENST00000567114	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	AKAP5	P24588	427 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	ABHD8	Q96I13	439 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	STX10	O60499	249 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	FMO5	P49326	533 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	ENPEP	Q07075	957 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	RNF39	Q9H2S5	420 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	LACTBL1	A8MY62	500 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	IL18RAP	O95256	599 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	SURF1	Q15526	300 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	CBWD6	Q4V339	395 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RPUSD1-208	ENST00000567114	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		27.74	■■■□□ 2.03

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