RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565589.5

RNPS1-215, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 2

Gene RNPS1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-215	ENST00000565589	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	ADSSL1	Q8N142	457 aa		9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	IFT74	Q96LB3	600 aa		9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	MTMR9	Q96QG7	549 aa		9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	RAB34	Q9BZG1	259 aa		9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	GDE1	Q9NZC3	331 aa		9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	CDH7	Q9ULB5	785 aa		9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		9.27	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	ACKR2	O00590	384 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	MICAL2	O94851	1124 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	GLRA2	P23416	452 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	RPA1	P27694	616 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	TXK	P42681	527 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	NAMPT	P43490	491 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	TRAPPC10	P48553	1259 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	RAB33A	Q14088	237 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	PDIA5	Q14554	519 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	PPP2R5D	Q14738	602 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	KANK3	Q6NY19	840 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	PALB2	Q86YC2	1186 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	KIFAP3	Q92845	792 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	TNFRSF25	Q93038	417 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	CPB2	Q96IY4	423 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	ZFP42	Q96MM3	310 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	AIFM3	Q96NN9	605 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	IER2	Q9BTL4	223 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	BCO2	Q9BYV7	579 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	MIOS	Q9NXC5	875 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	CDH22	Q9UJ99	828 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	ZNF197	O14709	1029 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	SPTLC1	O15269	473 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	PI15	O43692	258 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	B4GALT3	O60512	393 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	NPTXR	O95502	500 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	CFH	P08603	1231 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	CYP11B2	P19099	503 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	SCP2	P22307	547 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	AKAP5	P24588	427 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	HTR4	Q13639	388 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	PSMD5	Q16401	504 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	RUBCN	Q92622	972 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	MYADM	Q96S97	322 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	APOL6	Q9BWW8	343 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	HES2	Q9Y543	173 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	KRBA1	A5PL33	1030 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589		H7C4K7	107 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589		K7ERI5	159 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RNPS1-215	ENST00000565589	LAD1	O00515	517 aa		9.24	□□□□□ -0.93

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