RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559494.1

TSPAN3-207, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN3, Length 1,326 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-207ENST00000559494 URGCPQ8TCY9 931 aa22.19■■□□□ 1.14
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TSPAN3-207ENST00000559494 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPAN3-207ENST00000559494 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPAN3-207ENST00000559494 A0A0B4J269 797 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN3-207ENST00000559494 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.18■■□□□ 1.14
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TSPAN3-207ENST00000559494 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN3-207ENST00000559494 EXOC1Q9NV70 894 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN3-207ENST00000559494 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN3-207ENST00000559494 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.18■■□□□ 1.14
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TSPAN3-207ENST00000559494 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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TSPAN3-207ENST00000559494 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.16■■□□□ 1.14
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TSPAN3-207ENST00000559494 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.15■■□□□ 1.14
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TSPAN3-207ENST00000559494 DSC1Q08554 894 aa22.13■■□□□ 1.13
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TSPAN3-207ENST00000559494 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 ALDH2P05091 517 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 THP07101 528 aa22.12■■□□□ 1.13
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