RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557397.5

TIMM9-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 4

Gene TIMM9, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-210	ENST00000557397	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	UBXN4	Q92575	508 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC5A5	Q92911	643 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	ADAM2	Q99965	735 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	COX11	Q9Y6N1	276 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	BLOC1S1	P78537	153 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	PRR16	Q569H4	304 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	INSL6	Q9Y581	213 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	RPTOR	Q8N122	1335 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	DRGX	A6NNA5	263 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	SPDEF	O95238	335 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	CRHR1	P34998	444 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	PDCD1	Q15116	288 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	MFSD3	Q96ES6	412 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	RNF181	Q9P0P0	153 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	PLAA	Q9Y263	795 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	CDC45	O75419	566 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	ESRRB	O95718	433 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	TYRP1	P17643	537 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	CXCR5	P32302	372 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	PLA2G5	P39877	138 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	FLT3LG	P49771	235 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	CHN2	P52757	468 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	MXRA7	P84157	204 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	UGT8	Q16880	541 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	COLEC12	Q5KU26	742 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF480	Q8WV37	535 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	ASB10	Q8WXI3	467 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	NEU1	Q99519	415 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	FEZ1	Q99689	392 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	MARCH11	A6NNE9	402 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	PJA2	O43164	708 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	PHF2	O75151	1096 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	PTPN7	P35236	360 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	MPL	P40238	635 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	CLRN1	P58418	232 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	ADCY6	O43306	1168 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	AKR1B10	O60218	316 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	CFI	P05156	583 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	MPP3	Q13368	585 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	REPS2	Q8NFH8	660 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC9A6	Q92581	669 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	RSAD1	Q9HA92	442 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	EDAR	Q9UNE0	448 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TIMM9-210	ENST00000557397		A0A087X0B3	334 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	CDKL5	O76039	1030 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	ITGAM	P11215	1152 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	PTH2R	P49190	550 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	MED25	Q71SY5	747 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	GPR156	Q8NFN8	814 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	USP7	Q93009	1102 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	RAX2	Q96IS3	184 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	DPP7	Q9UHL4	492 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	MAST3	O60307	1309 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	BPI	P17213	487 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TIMM9-210	ENST00000557397	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5

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