RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557172.5

KLC1-223, Transcript of kinesin light chain 1, human

TSL 4

Gene KLC1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KLC1-223	ENST00000557172	USP37	Q86T82	979 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KLC1-223	ENST00000557172	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KLC1-223	ENST00000557172	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KLC1-223	ENST00000557172	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KLC1-223	ENST00000557172	TMC2	Q8TDI7	906 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KLC1-223	ENST00000557172	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
KLC1-223	ENST00000557172	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
KLC1-223	ENST00000557172	VPS16	Q9H269	839 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KLC1-223	ENST00000557172	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KLC1-223	ENST00000557172	IFNK	Q9P0W0	207 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KLC1-223	ENST00000557172	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
KLC1-223	ENST00000557172	TBX21	Q9UL17	535 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KLC1-223	ENST00000557172	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		10.65	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	KIAA0355	O15063	1070 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	AP5Z1	O43299	807 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	STX10	O60499	249 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	NPTXR	O95502	500 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	STAG3L1	P0CL83	205 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	CYP2C18	P33260	490 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	GRM5	P41594	1212 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	VAMP7	P51809	220 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	CYP24A1	Q07973	514 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	DSC3	Q14574	896 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	MBTPS1	Q14703	1052 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	NR1I3	Q14994	352 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	SURF1	Q15526	300 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	UBXN11	Q5T124	520 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	SEPT8	Q92599	483 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ACAP3	Q96P50	834 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	NDST4	Q9H3R1	872 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172		A0A1B0GTH6	734 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	FAM189A1	O60320	539 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	NBN	O60934	754 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	IL18RAP	O95256	599 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ADCY5	O95622	1261 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TIMP1	P01033	207 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ADRB2	P07550	413 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	SKI	P12755	728 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	RFC2	P35250	354 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF75D	P51815	510 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	CCL23	P55773	120 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	OSTN	P61366	133 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	UBXN1	Q04323	297 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	KCNH2	Q12809	1159 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	BFSP1	Q12934	665 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	GPNMB	Q14956	572 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	PSMD6	Q15008	389 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	SEZ6	Q53EL9	994 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	HACE1	Q8IYU2	909 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	SLC35C1	Q96A29	364 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	FNBP1	Q96RU3	617 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ADAM2	Q99965	735 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TMX1	Q9H3N1	280 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ARID2	Q68CP9	1835 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	WDR81	Q562E7	1941 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172		A0A0U1RQF3	1178 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	LGALS16	A8MUM7	142 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF623	O75123	536 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	CXCL10	P02778	98 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	RAG1	P15918	1043 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	GTF2H1	P32780	548 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TNFSF9	P41273	254 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	RAB27A	P51159	221 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	AP3M2	P53677	418 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	FAM189B	P81408	668 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	MIIP	Q5JXC2	388 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	CD302	Q8IX05	232 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	CEP120	Q8N960	986 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	APBB2	Q92870	758 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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