RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556749.1

TTC7B-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 4

Gene TTC7B, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-210ENST00000556749 SLITRK3O94933 977 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 LYPLA2O95372 231 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 CTDNEP1O95476 244 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 C1RP00736 705 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 P4HBP07237 508 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 ASGR2P07307 311 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 CNPP09543 421 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 SKIP12755 728 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 FDPSP14324 419 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 NCLP19338 710 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 NBL1P41271 181 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 RAB27AP51159 221 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 FGD1P98174 961 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 POU5F1BQ06416 359 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 NR5A1Q13285 461 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 MTMR3Q13615 1198 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 GIT2Q14161 759 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 EPHA7Q15375 998 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 INF2Q27J81 1249 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 KIAA0319Q5VV43 1072 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 PLA2G4FQ68DD2 849 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 CES5AQ6NT32 575 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 LILRA6Q6PI73 481 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 KRT25Q7Z3Z0 450 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 RHPN2Q8IUC4 686 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 GPR65Q8IYL9 337 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 RNF169Q8NCN4 708 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 TMEM169Q96HH4 297 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 HSD17B14Q9BPX1 270 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 TMEM175Q9BSA9 504 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 NFKBIZQ9BYH8 718 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 CHST7Q9NS84 486 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 GJB4Q9NTQ9 266 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 MIOSQ9NXC5 875 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 KCNJ14Q9UNX9 436 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 NR2E1Q9Y466 385 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 KMT2EQ8IZD2 1858 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 GPR179Q6PRD1 2367 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 F8W810 466 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 NRP1O14786 923 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 ASAP2O43150 1006 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 TSPAN1O60635 241 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 PFKFB2O60825 505 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 REC8O95072 547 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 SOD2P04179 222 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 ALDH2P05091 517 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 BMP2P12643 396 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 SP100P23497 879 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 YWHABP31946 246 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 ARL2P36404 184 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 DNM2P50570 870 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 CLCN5P51795 746 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 PTENP60484 403 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 MBTD1Q05BQ5 628 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 SCRN1Q12765 414 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 LETM2Q2VYF4 491 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 LONRF3Q496Y0 759 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 ASCL5Q7RTU5 278 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 TAS1R1Q7RTX1 841 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 CATSPER4Q7RTX7 472 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 ZBTB33Q86T24 672 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 FERMT3Q86UX7 667 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 PPFIBP1Q86W92 1011 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 EXOC8Q8IYI6 725 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 COLGALT2Q8IYK4 626 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 TRIM22Q8IYM9 498 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 CCDC116Q8IYX3 515 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 ADAM32Q8TC27 787 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 SLC7A3Q8WY07 619 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 TMEM143Q96AN5 459 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 PGBD4Q96DM1 585 aa5.05□□□□□ -1.6
TTC7B-210ENST00000556749 CCDC51Q96ER9 411 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms