RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.55■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.55■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 GOLGA8RI6L899 631 aa20.55■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 ABCD1P33897 745 aa20.55■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 KCNJ1P48048 391 aa20.55■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 KDSRQ06136 332 aa20.55■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 TTI2Q6NXR4 508 aa20.55■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.55■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 ALG6Q9Y672 507 aa20.55■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 PDHBP11177 359 aa20.55■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 CA8P35219 290 aa20.55■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 DONSONQ9NYP3 566 aa20.55■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.55■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 TMEM253P0C7T8 217 aa20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 TFDP2Q14188 446 aa20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 BAG5Q9UL15 447 aa20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 SCP2P22307 547 aa20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 ITIH4Q14624 930 aa20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 MED21Q13503 144 aa20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 KIF22Q14807 665 aa20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 NRBF2Q96F24 287 aa20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 CYP26A1O43174 497 aa20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 COPB2P35606 906 aa20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 CARD9Q9H257 536 aa20.54■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 HIC1Q14526 733 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 PRPSAP1Q14558 356 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 HIF1AQ16665 826 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 MTERF2Q49AM1 385 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 C12orf60Q5U649 245 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 KDM4CQ9H3R0 1056 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 KCTD2Q14681 263 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 DTNBP1Q96EV8 351 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 BTBD6Q96KE9 485 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 HAUS8Q9BT25 410 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 NAGPAQ9UK23 515 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 K7ERI5 159 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 SLC16A4O15374 487 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 CALB1P05937 261 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 ENO1P06733 434 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 FMO5P49326 533 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 CDO1Q16878 200 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 MED10Q9BTT4 135 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 TSSK1BQ9BXA7 367 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 EHD4Q9H223 541 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.53■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 PXDNQ92626 1479 aa20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 MYBL1P10243 752 aa20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 SERPINB4P48594 390 aa20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 ANKMY2Q8IV38 441 aa20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC68Q9H2F9 335 aa20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 LRRC36Q1X8D7 754 aa20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 FAM160B2Q86V87 743 aa20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 DCAF4Q8WV16 495 aa20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 IP6K2Q9UHH9 426 aa20.52■□□□□ 0.88
SUDS3-204ENST00000543473 CAND2O75155 1236 aa20.52■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 COMTP21964 271 aa20.52■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 TROAPQ12815 778 aa20.52■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.52■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.51■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 EYA4O95677 639 aa20.51■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ITKQ08881 620 aa20.51■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 P3H1Q32P28 736 aa20.51■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.51■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ZBTB33Q86T24 672 aa20.51■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 TEKT4Q8WW24 435 aa20.51■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 VPS11Q9H270 941 aa20.51■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms