RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 ULK4Q96C45 1275 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ZDHHC15Q96MV8 337 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 MFSD1Q9H3U5 465 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 MSRAQ9UJ68 235 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 IPPQ9Y573 584 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 IGSF3O75054 1194 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 PRCPP42785 496 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 PRAMEP78395 509 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 RMDN2Q96LZ7 410 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 PARVAQ9NVD7 372 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 TBK1Q9UHD2 729 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 PCK1P35558 622 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM132BQ14DG7 1078 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF484Q5JVG2 852 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ANKS3Q6ZW76 656 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ARHGAP18Q8N392 663 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 CDCA5Q96FF9 252 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 JMJD4Q9H9V9 463 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 TTLL13PA6NNM8 815 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 SERPIND1P05546 499 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 PRR29P0C7W0 189 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 RPS6P62753 249 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 IRX4P78413 519 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 RCN2Q14257 317 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 LBRQ14739 615 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM72Q6ZMU5 477 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 PDIK1LQ8N165 341 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM54Q9BYV2 358 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 TBKBP1A7MCY6 615 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF286BP0CG31 522 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 AKT1P31749 480 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 PHEXP78562 749 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 TAP1Q03518 808 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 PDZD8Q8NEN9 1154 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 EPB41L5Q9HCM4 733 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 TUBE1Q9UJT0 475 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ORC6Q9Y5N6 252 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 KRT7P08729 469 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 STILQ15468 1287 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 TMCO4Q5TGY1 634 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 GPATCH11Q8N954 259 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 COG4Q9H9E3 785 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 KCNH7Q9NS40 1196 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 OGFRQ9NZT2 677 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 MST1RQ04912 1400 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 GOLGA8MH3BSY2 632 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ATPAF2Q8N5M1 289 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ASAP3Q8TDY4 903 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 PRR23AA6NEV1 266 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 EGFRP00533 1210 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 DNAJB2P25686 324 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 GUCY1A2P33402 732 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ATP1A2P50993 1020 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ACTR2P61160 394 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 SLITRK1Q96PX8 696 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 VPS33BQ9H267 617 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 H0Y626 953 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ANP32DO95626 131 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 VCAM1P19320 739 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 SERPINB6P35237 376 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ARL4CP56559 192 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 NOP14P78316 857 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 UNC45AQ9H3U1 944 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 DPP7Q9UHL4 492 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 FKTNO75072 461 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 BAG2O95816 211 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 VTNP04004 478 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 ACADMP11310 421 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 CLCN1P35523 988 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-204ENST00000538708 TAF6P49848 677 aa10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms